基于癌癥 Cytogenomics 芯片協會的設計

2011 年 10 月，蒙特利爾——安捷倫科技公司（紐約證交所：A）今日發布 SurePrint G3 CGH+SNP 癌癥目錄芯片，該款芯片能夠在同一實驗中檢測出癌癥組織樣本中的拷貝數和中性拷貝變異，將極大地滿足研究人員日益增長的此類需求。

安捷倫發布芯片的同時還發布了 CytoGenomics 2.0 軟件，該款軟件用于支持對遺傳學復雜的樣本，例如血液類癌癥樣本進行 CGH+SNP 分析。

這款新型芯片是基于癌癥 Cytogenomics 芯片協會的設計，連同安捷倫世界一流的 CGH+SNP 芯片與 ISCA 芯片一起，成為細胞遺傳學研究中不可或缺的重要工具。

貝勒醫學院人類分子遺傳學教授 Marilyn M. Li 說道：“癌癥遺傳學領域迫切需要一個兼具 CGH 和 SNP 微陣列所有優勢的平臺。整合后的 CGH-SNP 平臺能夠檢測基因組上中性拷貝數變異，拷貝數擴增、雜合性缺失以及在單核苷酸多態性（SNP）沙漠區域的拷貝數變異。包含 SNP 探針的CGH 微陣列，能夠提高檢測低比例嵌合現象的準確度，還有助于測定癌癥基因組的倍體形式�；�于SNP 探針提供的等位基因信息具有極其重要意義。例如，SNP 等位基因譜有助于區分哪些是真正的高亞二倍體，哪些是亞二倍體的復制，從而深入了解疾病演化�！�

安捷倫基因組學高級營銷總監 Kathleen Shelton 談到：“多年來，我們的雙色 CGH 芯片平臺廣泛用于癌癥研究，發表的論文多達幾百篇。我們非常自豪地推出這款芯片，它融入了中性拷貝數雜合性缺失（LOH） 分析功能，能夠獲得與拷貝數數據同等準確的結果，在同款芯片上實現了5-Mb 的 LOH 分辨率�！�

安捷倫同時發布了 CytoGenomics 2.0 軟件，芯片用戶可免費獲得，用于對 SurePrint CGH+SNP 癌癥芯片實驗得到的數據進行分析。CytoGenomics 2.0 軟件采用新的算法，能夠分析基因組復雜的樣本（常見于拷貝數變異導致的癌癥）、腫瘤異質性樣本、腫瘤細胞和正常細胞的混合樣本。

除了目錄芯片，安捷倫還提供 SurePrint G3 CGH+SNP 癌癥芯片簡單定制的功能。通過安捷倫 eArray 在線設計工具，用戶可在 65,000 個SNP探針以及 2800 萬個預審的 CGH 探針中隨意選擇。

這些新產品進一步擴充了安捷倫種類齊全的基因組解決方案大軍，包括 Bravo 自動化液體處理平臺、新一代 SureScan 芯片掃描儀、各種試劑以及生物信息學軟件。安捷倫還就世界一流的 SureSelect XT 靶向序列捕獲系統為進行新一代測序提供完善的樣品制備工作流程。

要了解更多信息，請訪問 www.agilent.com/genomics/cgh_snp。