羅氏推出新的v2.8軟件 GS FLX+系統(tǒng)測(cè)序表現(xiàn)更優(yōu)秀
GS FLX+ 2.8軟件帶來(lái)更多的出色表現(xiàn)
GS FLX+系統(tǒng)連續(xù)創(chuàng)新，基于同樣的機(jī)器，相同的化學(xué)反應(yīng)，推出新的v2.8軟件，帶來(lái)更優(yōu)秀的測(cè)序表現(xiàn)。目前基于軟件的優(yōu)化可達(dá)到穩(wěn)定的高質(zhì)量，更長(zhǎng)讀長(zhǎng)的Shotgun測(cè)序結(jié)果。
更長(zhǎng)的讀長(zhǎng)更易于檢測(cè)復(fù)雜基因組的全新變異，可對(duì)基因組、轉(zhuǎn)錄組和宏基因組學(xué)研究中一些測(cè)序困難的區(qū)域進(jìn)行分析。
| 圖1 GS FLX+系統(tǒng)用2.8軟件對(duì)人DNA樣本進(jìn)行測(cè)序后的結(jié)果。曲線顯示出堿基數(shù)隨著序列長(zhǎng)度的分布情況。藍(lán)色部分與陰影交界處可看出50%的總堿基數(shù)與序列長(zhǎng)度對(duì)應(yīng)關(guān)系。不同測(cè)序結(jié)果與樣本特性與基因組特性有關(guān)。 |
除了更長(zhǎng)讀長(zhǎng)的表現(xiàn)，v2.8在GS Reference Mapper軟件中增加了對(duì)多樣本結(jié)果分離的功能，以及SNP檢測(cè)效果上的提升。在GS Amplicon Variant Analyzer軟件中增加了對(duì)單堿基插入缺失的自動(dòng)查找，提供更加簡(jiǎn)便的Amplicon測(cè)序分析流程的構(gòu)建。
許多升級(jí)至v2.8的用戶都表示，v2.8的軟件能帶來(lái)讀長(zhǎng)上約200bp的提升，總體測(cè)序量上約20%的增加，454測(cè)序的超長(zhǎng)讀長(zhǎng)在全基因組denovo拼接、cDNA拼接和可變剪切的檢測(cè)方面都有優(yōu)秀表現(xiàn)。
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