羅氏454測(cè)序技術(shù)提高HIV耐藥檢測(cè)靈敏度
利用454測(cè)序技術(shù)進(jìn)行HIV耐藥檢測(cè)可提高靈敏度
HIV耐藥性是指病毒對(duì)某種藥物敏感性降低，在某些核酸類藥物抑制下，病毒可通過(guò)自身基因突變獲得對(duì)這些藥物的抗藥性，而當(dāng)有抗藥性的病原微生物再傳染他人時(shí)，即可對(duì)這些藥物產(chǎn)生抗藥性。由于HIV繁殖存在錯(cuò)誤率高的逆轉(zhuǎn)錄這一獨(dú)特的復(fù)制過(guò)程，因此在藥物治療中也最易出現(xiàn)耐藥性。當(dāng)前，HIV耐藥株已成為醫(yī)學(xué)界面臨的一個(gè)新挑戰(zhàn)。HIV耐藥檢測(cè)可用于HIV感染的輔助診斷、病程監(jiān)控、指導(dǎo)治療方案及療效判定、預(yù)測(cè)疾病進(jìn)展等。傳統(tǒng)的基因型檢測(cè)方法是將HIV病毒的Pol基因區(qū)(蛋白酶區(qū)和逆轉(zhuǎn)錄酶區(qū))序列進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄擴(kuò)增，通過(guò)Sanger測(cè)序技術(shù)獲得序列信息，與全球HIV耐藥基因數(shù)據(jù)對(duì)比分析耐藥位點(diǎn)，得到耐藥結(jié)果。這種檢測(cè)方法只能看到高于20%含量的耐藥位點(diǎn)突變情況，而且不能進(jìn)行定量檢測(cè)。
近期，有研究者們利用GS Junior平臺(tái)一次性檢測(cè)10個(gè)HIV臨床樣本，這些病人之前用傳統(tǒng)技術(shù)診斷過(guò)，有9名發(fā)生了耐藥突變，另外11名沒(méi)有發(fā)生耐藥突變。結(jié)果在11人中的6人檢測(cè)結(jié)果里發(fā)現(xiàn)了新的低頻耐藥突變，發(fā)現(xiàn)的低頻耐藥突變種類高達(dá)50種。
該研究充分說(shuō)明，利用454深度測(cè)序技術(shù)可以達(dá)到傳統(tǒng)檢測(cè)方法無(wú)法檢測(cè)的靈敏度，除了可以進(jìn)行定量檢測(cè)耐藥位點(diǎn)突變情況外，還可檢測(cè)低至1%的突變情況，從而為HIV治療提供了更加準(zhǔn)確的信息。該研究成果也發(fā)表在2013年1月的《臨床微生物學(xué)》雜志上。
參考文獻(xiàn)：
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