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BPRC第五期蛋白質組信息學培訓班(第二輪)通知

瀏覽次數:5929 發布日期:2016-7-13  來源:本站 本站原創,轉載請注明出處

北京蛋白質組研究中心第五期蛋白質組信息學培訓班通知

北京蛋白質組研究中心第五期蛋白質組信息學培訓班
 
(第二輪通知)
時間:2016年8月2-5日
地點:北京蛋白質組研究中心(北京市昌平區科學園路38號,中關村生命科學園內)
 
主辦單位
國家蛋白質科學中心·北京(鳳凰中心)
北京蛋白質組研究中心(BPRC)    
蛋白質組學國家重點實驗室(SKLP)
中國生物化學與分子生物學會蛋白質組學專業委員會(CNHUPO)
 
國家蛋白質科學中心•北京(簡稱“鳳凰中心”)/北京蛋白質組研究中心(BPRC)坐落在國家科技創新示范區——中關村生命科學園,是我國生命科學領域的國家科技基礎設施,也是國際人類肝臟蛋白質組計劃執行總部、蛋白質組學國家重點實驗室和首都科技條件平臺。
 
鳳凰中心/BPRC在以院士領銜,入選國家杰青、北京市科技新星為骨干的專家團隊帶領下,在生命科學領域不斷開拓,建立了高通量、高分辨率、高精度的蛋白質組學,以高性能“天河”超級計算機為核心的生物信息學,蛋白質相互作用,多功能多層次顯微成像,流式分選,模式生物構建,抗體藥物篩選等技術體系與平臺。我們愿與從事生命科學研究的有識之士一起,推動生命科學新發現、新技術、新產品的涌現,實現“創造歷史,引領世界”的夢想。
 
培訓目的
本課程為生命科學研究人員介紹如何合理利用和開發蛋白質生物信息學資源。課程著眼于實際數據庫搜索、工具使用、大型數據庫分析、生物學網絡構建、可視化和數據分析等。采取小班授課,專人指導;理論課與實踐課相結合,講師與學員研討的方式進行;精心挑選相應的上機軟件,提供充足的實際操作機會;讓每位學員學有所成。
 
培訓對象
● 從事生命科學、農學、醫學等領域科研工作者和高校教師及研究生
● 迫切希望提升生物信息分析能力的學者
 
培訓內容
質譜數據深度分析、蛋白質注釋及功能分析、蛋白質相互作用網絡構建及分析、蛋白質組研究主題信息服務和專業數據庫研發。
 
課程安排
2016年8月2日
主持人:楊 冬 朱偉民
主題:蛋白質組信息學  蛋白質鑒定
時間
主講人
培訓內容
9:00-10:00
講座
朱偉民
● 課程介紹
● 蛋白質組學
● 蛋白質組信息學工作流程
10:00-10:45
講座
朱偉民
工作流原理
● 序列數據庫
● 肽段鑒定
● 蛋白組裝
● 蛋白定量
● 質量控制和標準
10:45-11:00
茶歇
11:00-11:45
講座
楊 冬
工作流原理
● 翻譯后修飾
● 數據挖掘
● 數據注釋
● 聚類和其他分析
11:45-12:30
練習
楊 冬
常用的生物信息數據庫和工具
12:30-13:30
午餐
13:30-14:30
講座
楊 冬
Mascot:實踐中的搜索工具
14:30-15:15
練習
楊 冬
搜索工具的環境
15:15-15:30
茶歇
15:30-16:30
講座
楊 冬
搜索工具實際應用
16:30-17:15
講座
Henning Hermjakob
數據存儲與發布:ProteomeXchange
17:15
結束
2016年8月3日
主持人:朱云平
主題:定量蛋白質組
時間
主講人
培訓內容
9:00-10:00
講座
常 乘
標記定量蛋白質組學:母離子標記方法
10:00-10:45
講座
常 乘
標定定量蛋白質組學:子離子標記方法
10:45-11:00
茶歇
11:00-11:45
練習
常 乘
馬 潔
馮曉東
MaxQuant上機練習
11:45-12:30
練習
常 乘
馬 潔
馮曉東
MaxQuant上機練習
12:30-13:30
午餐
13:30-14:30
講座
常 乘
非標定量蛋白質組學
14:30-15:15
練習
常 乘
差異表達蛋白的統計分析
15:15-15:30
茶歇
15:30
講座
常 乘
PANDA和PANDA-view介紹
16:30
練習
常 乘
馬 潔
馮曉東
PANDA和PANDA-view上機練習
17:15
結束
2016年8月4日
主持人:馮晉文
主題:工作流  數據發布
時間
主講人
培訓內容
9:00
講座
馮晉文
TPP(trans proteome pipeline)數據分析平臺介紹
10:00
練習
馮晉文
 
● 基于X!Tandem肽段鑒定
● 基于peptide Prophet肽段驗證
10:45-11:00
茶歇
11:00
練習
馮晉文
蛋白質定量
● Libra
蛋白質組裝
● Protein Prophet
11:45
練習
馮晉文
實際操作
12:30-13:30
午餐
13:30
講座
馮晉文
Firmiana簡介
14:30
練習
馮晉文
Firmiana上機練習
15:15-15:30
茶歇
15:30
講座
馬 潔
基于Iprox的數據存儲
16:30
練習
馬 潔
實際操作:基于Iprox的數據存儲
17:15-18:00
參觀Phoenix center
2016年8月5日
主持人:李棟
主題:網絡和通路
時間
主講人
培訓內容
9:00
講座
李 棟
蛋白質網絡的構建與分析
10:00
講座
李 棟
蛋白質數據集深度挖掘
10:45
茶歇
11:00
練習
李 棟
網絡工具介紹:
● KEGG, Reactome
● STRING
11:45
練習
李 棟
上機練習
12:30
午餐
13:30
講座
劉中揚
Cytoscape簡介
14:30
練習
劉中揚
Cytoscape上機練習
15:15-15:30
茶歇
15:30-16:30
練習
劉中揚
Cytoscape上機練習
17:15
結束
 
培訓費用
● 即日起至8月1日之間注冊:每人4500元,學生4000元。
● 網上注冊地址:(見下方二維碼)
● 培訓費用包含:培訓資料、培訓期間的午、晚餐。
● 住宿費用自理,請自行聯系酒店登記住宿信息。
 
報到時間和地點
● 報到:8月1日全天,鳳凰中心/BPRC
● 培訓:8月2-5日,鳳凰中心/BPRC (北京市昌平區科學園路38號,中關村生命科學園內)。
● 住宿:北京梧桐苑商務酒店(緊鄰鳳凰中心大樓),預訂電話:010-61777200(預定時請說明參加此次培訓)
● 學員自備筆記本電腦(具有WiFi無線網絡功能)用以操作練習。
 
注意事項
參加本期培訓班的學員可以享受中心提供的技術服務優惠政策。技術服務項目請看網站:http://www.bprc.ac.cn/guidance/list.php?catid=27 或 http://www.ncpsb.org/cn/%E6%9C%8D%E5%8A%A1
 
匯款信息
帳    號:0200004909200041055
賬戶名稱:北京蛋白質組研究中心
開戶銀行:工商銀行北京市永定路支行
注:匯款時請務必注明學員姓名、單位和“信息學培訓班”字樣。匯款后將匯款憑據傳真至中心,或將掃描電子版發送至郵箱dw3026@163.com,以確保匯款安全到賬。
如需發票請注明發票抬頭,培訓結束后統一開具發票(培訓費、會議費、技術服務費等)。
 
聯系方式
聯系電話:注冊:(010)61777015
          咨詢:(010)61777010
傳    真:(010)61777050
電子郵件:dw3026@163.com
通信地址:北京市昌平區科學園路38號(102206)
北京蛋白質組研究中心第五期蛋白質組學培訓班通知
 

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