Illumina與倫德貝克基金會攜手構建人類基因組數據集
瀏覽次數:4992 發布日期:2019-3-26
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Illumina與倫德貝克基金會地理遺傳學中心(Lundbeck Foundation Centre for GeoGenetics)攜手構建全球最大的古人類基因組數據集之一,解碼精神健康問題的基因起源和演進過程
世界一流的科研團隊將借助功能強大、準確度卓越的Illumina NovaSeq測序系統揭秘古往今來人類DNA與人類疾病之間的相互作用
丹麥哥本哈根——2019年3月26日——Illumina將與丹麥哥本哈根大學的倫德貝克基金會地理遺傳學中心(Lundbeck Foundation Centre for GeoGenetics)開展合作,共同探究某些精神疾病和神經疾病的疾病演進史與感染性病原體之間的關系。該項目屬全球首例,旨在發掘出全新的知識,從醫學和生物學視角理解古往今來驅使人類神經精神疾病不斷演進的特殊因素。最后,本項目還有望為開發精神/神經疾病治療藥物和其他治療手段提供一種新的方法。
腦部疾病從何而來?為揭示微生物在阿茨海默病和精神分裂癥等神經精神疾病的發病機理中扮演什么樣的角色,Eske Willerslev教授及其國際研究團隊將繪制數千具古歐亞人殘骸的完整DNA圖譜,并據此構建全球最大的基因組數據集之一。他們將從殘骸的骨和牙齒中采集數據,其中最古老的材料可追溯至10,000年以前。
這個多學科研究團隊匯集了古基因組學、神經遺傳學、群體遺傳學、考古學、語言學、腦健康等眾多領域的專家,將致力于構建兩個獨特的基因組數據子集。第一個panel覆蓋5,000個古人類基因組,第二個panel則包括與人類疾病相關的古病原體DNA。這兩個panel都將公開發布,共同助力我們深入研究疾病變異的演進,以及疾病變異與人類基因組和病原體之間的相互作用。該項目將構建并分析有史以來最大的古人類和病原體基因組panel。
劍橋大學教授、菲利普親王勛章獲得者(Prince Philip Professor)、哥本哈根大學倫德貝克基金會(Lundbeck Foundation)教授Willerslev表示:“在過去10,000多年的歷史長河中,我們人類的生活方式經歷了許多重大變化。從采獵時代進入農耕時代后,我們的飲食、聚落模式都發生了變化,隨著居住環境改變,我們被環境病原體微生物感染的風險也隨之發生變化。我們還知道,慢性病毒、細菌和真菌感染也可能誘發神經精神疾病,因此我們完全有理由相信,通過分析當時的DNA,可以揭示這些疾病演進的趨勢,讓我們可以構建全新的公開參考數據集,進而增強科研領域和醫療保健領域對疾病演進的理解。”
為解碼人類疾病的基因起源和演進過程,Willerslev教授及其團隊將在他們的研究中應用Illumina功能最為強大的測序儀——NovaSeq™6000系統。該系統經專門設計,開辟了擴大實驗規模、提升實驗穩定性的全新視野,其高通量優勢能夠為大型隊列研究提供有力支持。這種規模的項目將受益于分析速度、通量和數據質量,因此該項目將使用S4流動槽,將測序通量提升至每兩天測定多達200億個古人類DNA片段。
“NovaSeq 6000擁有無與倫比的數據質量和高通量優勢,是本項目的不二之選。”Willerslev教授補充道,“盡管我們多年前就已經構想出這個探究遺傳性疾病基因起源的項目,但在Illumina的NovaSeq系統上市之前,那都只是不可能實現的構想而已。我們很高興倫德貝克基金會高瞻遠矚地預見到了我們這個項目的重要性,也很高興Illumina技術讓這項研究得以實施。”
Illumina歐洲、中東和非洲地區高級副總裁兼總經理Paula Dowdy表示:“Illumina非常期待與Willerslev教授及其團隊合作,共同開展這個意義非凡的研究項目。如果我們能通過追溯過去10,000年來的DNA發掘出一些新的信息,了解與腦部疾病相關的基因是何時,以及在怎樣的環境條件下被引入人類DNA的,這將成為無價的研究成果。這個項目可提供有關精神疾病患者的深刻見解,有望助力未來基因療法和精準醫療產品的開發。”
關于Illumina
Illumina公司通過解碼基因組而改善人類健康。我們注重創新,這使我們成為DNA測序和芯片技術的全球領導者,并為科研、臨床和應用市場的客戶提供服務。我們的產品應用在生命科學、腫瘤學、生殖保健、農業及其他新興市場上。如欲了解更多信息,請訪問
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關于德貝克基金會地理遺傳學中心(Lundbeck Foundation GeoGenetics Centre)
專注腦、疾病和進化研究的德貝克基金會地理遺傳學中心(Lundbeck Foundation GeoGenetics Centre)是世界一流的卓越研究中心,主要研究遠古時期人類和病原體的DNA以及環境DNA。該中心最初作為丹麥國家研究基金會卓越研究中心成立于2009年,之后在倫德貝克基金會(Lundbeck Foundation)、嘉士伯基金會(Carlsberg Foundation)、諾和諾德基金會(Novo Nordisk Foundation)和惠康基金會(Wellcome Trust)的大力資助下持續運作至今。LF地理遺傳學中心位于丹麥哥本哈根大學內,是一個橫跨多個學科的研究機構,匯集了來自世界各地主攻不同學科的眾多科學家。在這里,我們致力于探索人類的遷徙、疾病的演進、為適應環境而產生的生活方式改變,以及語言的發展歷程,旨在了解“我們是誰”、“我們從哪來”、“未來我們將前往何方”。我們的目標是提升彼此對于作為人類的意義的認知,并通過理解疾病病因、尊重多樣性的方式減輕人類痛苦。