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蛋白質結構解析與智能設計專題(線上)培訓班通知

瀏覽次數:5066 發布日期:2023-11-29  來源:本站 本站原創,轉載請注明出處
關于舉辦“蛋白質結構解析與智能設計專題(線上)培訓班”的通知
 
各有關單位:
蛋白質通常被稱為生命的基石,它們幾乎參與了細胞內的每一個過程,包括生長、分裂和修復。蛋白質是生命活動的體現者,其結構決定著功能。由線性氨基酸組成的蛋白質需要折疊成特定的空間結構才具有相應的生理活性和生物學功能。解析蛋白質的空間結構可以更準確地認識蛋白質的功能、功能的執行、及生物大分子間的相互作用。然而,隨著人工智能及大數據的快速發展,蛋白質可以通過人工智能設計從而解鎖更多的功能,這在食品學、醫學和藥學的發展(如多肽、酶、藥物靶點的設計等)具有重要意義。因此,為了進一步挖掘蛋白質新功能與充分發揮人工智能在醫藥及生物領域的快速發展,協會決定于2024年1月13-14日線上(小鵝通平臺)舉辦“蛋白質結構解析與智能設計專題培訓班。”屆時將邀請行業內知名專家針對相關內容進行講解與探討。參會名額有限,望各有關單位積極轉發或組織相關人員盡快報名參加。現將有關事項通知如下:

一、會議安排:
直播平臺:小鵝通在線直播平臺
1月12日:下午15:00-15:30平臺網絡及設備測試
1月13日-14日:上午9:00-12:00,下午14:00-17:00培訓課程
(詳情參考附件一)
二、培訓形式
1、理論講解,實例分析,專題講授,互動答疑
2、完成全部培訓課程者由協會頒發培訓證書
三、組織機構
主辦單位:中國化工企業管理協會醫藥化工專業委員會
承辦單位:中科凱晟化工技術研究院
四、培訓課程及專家情況(詳情參考附件一)
五、培訓對象
1.蛋白質工程領域科研單位專家及學者;
2.醫學、藥學及食品學院校及企業蛋白質功能開發負責人;
3.生物工程領域從業工作者。
六、會議費用
4000元/單位,可投屏全員觀看(含5個直播鏈接、2本資料、1個月有效期回放)
七、問題及報告征集(截止到1月9日):
請在回執表問題征集欄填寫您所關注及遇到的問題,以便講師在備課時更具備針對性。
八、聯系方式:
電    話:13001080157(同微信)       
聯 系 人: 趙 蕊            
電子郵箱:zghg2012@126.com
 
附件一:會議課程安排表
附件二:參會報名表  

 
中國化工企業管理協會醫藥化工專業委員會
中科凱晟化工技術研究院
二○二三年十一月
 
 
附件一:
蛋白質結構解析與智能設計專題培訓班課程表
 
1月12日下午15:00-15:30線上測試
(第一天)1月13日
上午
 
09:00
-
12:00
 
 
 
 
 
 
下午
 
14:00
-
17:00
《蛋白質結構預測與解析》
1.蛋白質結構預測
蛋白質理化性質和一級結構分析
分析蛋白質的 pI、Mw、氨基酸組成、消光系數、穩定系數等
分析蛋白質的親水性和疏水性
分析蛋白質的跨膜區
信號肽預測 SignalP
蛋白質二級結構預測
蛋白質結構域預測
2.蛋白質表達純化
從基因克隆到蛋白表達
不同表達體系的質粒構建及優化
蛋白及復合物的表達及優化策略
蛋白質純化及表征
蛋白質的純化方案
蛋白復合物的制備和純化
天然蛋白的制備和純化
蛋白質的鑒定和理化性質分析
高難度蛋白質樣品制備的思路和方法
3.蛋白質結晶條件篩選和優化
蛋白晶體結構的特征
晶體的晶胞、晶系、空間群
蛋白晶體生長的理論知識
蛋白晶體生長條件初篩
蛋白晶體生長條件優化
4.晶體衍射數據收集與處理(XDS, HKL, Aimless)
X射線衍射
X射線衍射的原理
X射線衍射的電子密度
晶體結構解析的相角問題
上海光源線站BL18U1、BL19U1和BL02U1收集數據的方法
5.相位解析和優化(phenix,CCP4)
蛋白晶體結構解析軟件的安裝(包括Ubuntu系統、Phenix軟件、CCP4軟件、
PyMoL軟件、XDS軟件和Adxv軟件)
晶體結構解析流程
Index、Intergrate和Scale
分子置換技術
蛋白晶體結構的重建
蛋白晶體結構的優化
晶體結構質量的評價指標
蛋白質結構中加入小分子配體
在結構解析過程中,如何利用軟件提高分辨率
6.PDB數據提交
傅老師,畢業于美國東北大學。曾就職于默克集團,上海維亞生物公司。現于青云瑞晶負責x-ray晶體學結構解析工作,有豐富的蛋白質結構解析經驗。
陳老師,博士,蘇州青云瑞晶生物科技有限公司,結構生物學負責人。畢業于中國科學院生物物理研究所結構生物學專業,師從葉克窮教授從事RNA蛋白質復合物的結構生物學研究。從2009年開始蛋白質RNA復合物的結構生物學研究,有10年以上的蛋白質表達純化及結構解析經驗。在Elife、Nature Communication、Angewandte、Nucleic Acids Research等雜志發表多篇文章。在北京大學深圳研究生院、北京 生命科學研究所和北京大學化學與分子工程學院均進行過研究工作。在北京大學化學與分子工程學院博士后工作期間,解析了重要疾病靶點和小分子的結構,積累了豐富經驗。
(第二天)1月14日
上午
 
09:00
-
12:00
《蛋白質工程與定向進化》(溝通中...)
課程更新中敬請期待......
陳老師,博士,副教授。2007年畢業于中國科學技術大學生物化學與分子生物學系,獲理學博士學位。2007至2009年赴美國梅奧醫學院(Mayo Clinic)從事博士后工作,研究G蛋白偶聯受體的結構和功能。2009至2011年赴南加州大學從事鋅指蛋白的設計與篩選相關研究。2011年3月作為中國科技大學優秀人才引進,現任生命科學學院副教授。2009年獲17多肽調控國際會議優秀博士后獎。主要研究成果發表于Journal of Biological Chemistry, Am. J. Physiol. Endocrinol. Metab, Protein Science等相關領域國際重要期刊。
下午
 
14:00
-
17:00
《蛋白質序列和結構升級》
1.蛋白質化學組成與穩定蛋白質結構的分子相互作用
2 分子力場、統計能量與深度學習簡介
3 基于能量函數的蛋白質設計技術
4.基于深度學習的蛋白質設計技術
5.功能蛋白質設計展望

劉老師,男,中國科學技術大學講席教授。國家基金委杰出青年基金獲得者、創新群體項目負責人。1985-1996年在中國科學技術大學生物系學習并先后獲學士和博士學位。曾在蘇黎世高等理工學院研究生聯合培養以及在Duke大學和UNC Chapel Hill從事博士后研究等。2001年起任中國科學技術大學生命科學學院教授。主要研究方向為蛋白質設計和基于計算的蛋白質結構功能研究。在包括Nature及子刊、PNAS、JACS、PRL等雜志發表論文百余篇。

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