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SPT Labtech與Thermo Fisher合作推出NGS建庫方案

瀏覽次數:6388 發布日期:2021-5-18  來源:騰泉
文庫制備成本在如今大規模的NGS研究費用中所占的比重越來越重,經費和成本的限制阻礙了科學家對傳染病監測、癌癥研究等領域更深入探索的步伐。SPT Labtech宣布與Thermo Fisher Scientific進行市場合作,旨在構建自動化的文庫制備方案,以期提高建庫成功率,并降低variant檢測的費用。
 

 

高靈敏度的variant檢測現在可以通過使用SPT Labtech的mosquito HV genomics和dragonfly discovery系統進行自動化建庫,將反應體系微縮化,減少試劑使用量,降低1/10的成本,從而能夠在一組樣本中添加更多的replicates,提高建庫成功率和測序數據質量。 


此項方案將首先支持用于Illumina系統的Invitrogen Collibri全基因組測序文庫制備試劑盒,以及Collibri文庫定量試劑盒,包括SARS-CoV-2研究、癌癥研究中拷貝數變異以及其他突變檢測的應用。
 
一、更高的效率


SPT Labtech的mosquito HV genomics和dragonfly discovery系統可以快速編程,24/7全天候進行樣本制備工作,解放研究人員的時間。

dragonfly discovery、mosquito HV genomics及NGS實驗set up專用軟件

 
二、更高的成功率


使用SPT Labtech設備進行微縮化建庫,可將試劑的用量體積減少多達10倍,從而可以用不到1個樣本的成本,做5–6個replicates。樣本重復數量的增加,保障了即使某個樣品在flow cell上測序失敗,仍有其他樣品的數據可以使用,無需再重新準備樣本展開測序,從而確保了實驗一次成功。Invitrogen Collibri NGS文庫制備試劑盒中每種試劑含有一種示蹤染料,通過顏色變化可清晰觀察文庫制備過程,避免高代價的實驗失誤。

dragonfly discovery每個通道可以獨立進行試劑分配

 
三、更微量的樣本


SPT Labtech設備獨有的固相置換技術可以精確地處理微量液體,對0.5uL的粘稠樣本都有著極高的加樣精度。Invitrogen Collibri全基因組測序文庫制備試劑盒可從1 ng的樣本起始量提供均勻的基因組覆蓋度。Collibri ES DNA PCR-free建庫方案經過優化,可將 100 ng DNA 制備成足量測序文庫,足以用于文庫定量及在 Illumina NovaSeq 系統上進行兩次以上測序。PCR-free的建庫流程可在1.5小時內完成,一天內就可以將DNA轉化為數據,從而最大限度地提高實驗效率。

mosquito HV genomics的8/16通道進行樣本和index轉移

 
四、加速科學發現:提高實驗成功率并降低研究成本


SPT Labtech的產品戰略總監Joby Jenkins表示,在不犧牲結果質量的前提下降低NGS建庫成本是朝著科學民主化邁出的一大步。NGS技術發展迅速,對于每個實驗室來說,將最新的建庫方法進行自動化的流程搭建將會非常耗時,而我們的目標就是實現NGS建庫過程的自動化和微縮化,解決技術和方法上的挑戰,這樣科學家們就可以更關注于科學問題本身,擴大他們研究項目的范圍,最終對生命科學和人類健康產生更深刻的見解。



 

相關公司:SPT Labtech
聯系電話:400-151-8616
E-mail:marketing@sptlabtech.cn


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