• 數(shù)據(jù)質(zhì)控：去除接頭污染和低質(zhì)量數(shù)據(jù)；

• 與參考序列進行比對、統(tǒng)計測序深度及覆蓋度；

• 序列拼接組裝，交付質(zhì)粒序列fasta格式文件。

注：以下情況可能會有拼接結(jié)果不好的風險：a. 質(zhì)粒存在重復序列、高GC\AT結(jié)構(gòu)；b. 質(zhì)粒不純（相似度太高的質(zhì)粒無法通過本方法區(qū)分開）。

  案例展示：

​圖1.測序成環(huán)質(zhì)粒圖
 

圖2.質(zhì)粒序列FASTA格式文件

  送樣要求：

• 純菌：新鮮菌液≥200 μL，穿刺菌，冰袋運輸；

• 質(zhì)粒：濃度≥50 ng/μL，體積 ≥20 μL，主帶明顯、無降解無污染，務必用滅菌的雙蒸水溶解；

• 信息單詳細填寫載體名稱、質(zhì)粒大小及抗性，擎科提供Amp，Kana兩種抗生素。

寄樣地址：（請聯(lián)系當?shù)劁N售經(jīng)理寄送）
江蘇省南京市江寧區(qū)乾德路9號大樹科技2號樓五樓 
高通量測序組（收）  13851793730  

寄件須知：
冰袋保存寄送，建議選擇順豐快遞，寄樣時需要將《擎科生物高通量測序樣品信息單-全質(zhì)粒測序》（長按識別下方二維碼）打印出來隨樣本一起寄送。