小白：新課題確定了，導(dǎo)師想要我研究 XXX 關(guān)于 XXX 的疾病的研究，在選產(chǎn)品呢，蛋白，抑制劑，一一搜索 ing…

小 M：你是怎么選的？

小白：比如 EGFR, 在官網(wǎng)搜索框點擊 EGFR, 進(jìn)入靶點, 勾選類別,選擇排名在前的產(chǎn)品仔細(xì)研究。

 

小M：方法是個好方法，還有更便捷的方式 -- 基因作用數(shù)據(jù)庫。

小白：？？？這是個什么數(shù)據(jù)庫~

小M：這個數(shù)據(jù)庫基于海量熱門基因，整合了來自 HGNC (HUGO Gene Nomenclature Committee)，NCBI (national center for biotechnology information)，Ensembl (Ensembl genome browser 107），OMIM (Online Mendelian Inheritance in Man)，和 Gene Cards 等各大權(quán)威數(shù)據(jù)中心，混合與多類型數(shù)據(jù)庫的交互方式。同時，數(shù)據(jù)庫也配套提供了關(guān)聯(lián)疾病及化合物庫。

下面一起看看具體功能吧！

■ Quick Search 功能

通過 Search 基因名或基因符號，就可以看到該基因在不同物種下的所有名目。還是以 EGFR 為例，檢索后可以一覽該基因所屬的信號通路、同源信息，以及組織表達(dá)情況。

■ Flexible Browse 功能

點擊特定基因，進(jìn)入到詳情頁面。各個模塊集中展示了研究工作中重點關(guān)注信息。可以根據(jù)基因-蛋白-疾病-產(chǎn)品的順序，或點擊上方的浮動工具欄，按需獲取基礎(chǔ)信息。

例如蛋白模塊，下方列出了多種蛋白名稱用法，來源于已有研究/出版刊物的使用記錄。高頻率名稱將推薦為主名。

小白：是很方便，但我還有個疑問，比如我就想選擇一個 EGFR 重組蛋白，下面列出這么多，我該怎么判斷？

小M：下方列出的重組蛋白可用直接從名稱上知悉一二。

例如紅色框的內(nèi)容表明它是重組 EGFR 蛋白，綠色框表明來源物種，藍(lán)色框則說明了蛋白長度、表達(dá)體系、融合標(biāo)簽、以及是否生物素化。“蛋白編號” 列關(guān)聯(lián)了 Uniprot 這個蛋白資源寶庫，有更多好奇心的童鞋可以再探索更多信息~

(2) 常見的表達(dá)體系有 E.coli、CHO、Sf9、赤畢酵母等。

E.coli 適用于原核來源或無需翻譯后修飾的真核蛋白。CHO 是哺乳動物細(xì)胞，具有表達(dá)穩(wěn)定、蛋白修飾準(zhǔn)確的優(yōu)點。Sf9 昆蟲細(xì)胞則是桿狀病毒常用的表達(dá)宿主。赤畢酵母是甲醇營養(yǎng)酵母，可提取高純度重組蛋白。最后，應(yīng)根據(jù)具體情況選擇合適的表達(dá)系統(tǒng)。

(3) 融合標(biāo)簽是免疫分析的重要幫手，一般可增強(qiáng)蛋白可溶性、屏蔽毒性蛋白。應(yīng)選擇大小合適的標(biāo)簽用于后續(xù)實驗。

(4) 生物素化不干擾分子固有功能，可特異性結(jié)合鏈霉親和素或抗生物素蛋白，增加實驗設(shè)定。 
 

小白：聽起來好像有了些課題靈感。那么小分子抑制劑呢？人源鼠源都是EGFR，下面這些都是有用的產(chǎn)品？

小M：一般情況下，小分子藥物不區(qū)分種屬 (但是也要多看文獻(xiàn)!) 下面的 “關(guān)聯(lián)產(chǎn)品” 模塊按臨床階段分類，并進(jìn)一步細(xì)分為生物活性分子及抗體抑制劑 (需要注意種屬)。

1. 示例產(chǎn)品與 MCE 的產(chǎn)品目錄直接交互，點擊 可以跳轉(zhuǎn)產(chǎn)品詳情頁，了解試劑的更多生物信息。詳情頁還提供有體內(nèi)外的實驗示例哦，附有實驗條件和設(shè)定結(jié)果，小白你就不用為新產(chǎn)品入手太發(fā)愁了。

2. MCE 基因作用數(shù)據(jù)庫套用了 MedChemExpress (MCE) 專有罕見病產(chǎn)品庫，幫助你進(jìn)一步選取研究重心、開拓課題版圖。

3. 對于臨床中的產(chǎn)品，還詳盡展示了對應(yīng)的具體臨床階段