Immunai(NEBION)策劃了從大塊組織到單細胞的高質(zhì)量公共轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，與高性能但易于使用的工具GENEVESTIGATOR相結(jié)合，可以對公開轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進行全局和即時分析，以實現(xiàn)新的發(fā)現(xiàn)和驗證。

GENEVESTIGATOR涉及多種不同疾病，包括癌癥、自身免疫、纖維化、心血管或代謝疾病。大多數(shù)研究來自人類、小鼠和大鼠的數(shù)據(jù)。

GENEVESTIGATOR使用受控詞匯、領(lǐng)域?qū)＜业耐�行評審、嚴格的質(zhì)量控制和強大的全球數(shù)據(jù)集成平臺級標準化的分析工具。

大塊組織（Bulk Tissue）轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析

GENEVESTIGATOR同時分析數(shù)千項研究，以找到與藥物或疾病特別相關(guān)的基因，或者尋找與基因特征相關(guān)的狀況或疾病：

1.有效發(fā)現(xiàn)靶標和生物標志物

2.目標和生物標志物的直接優(yōu)先級排序和驗證

3.創(chuàng)新藥物的再利用和重新定位

4.識別相關(guān)實驗?zāi)Ｐ拖到y(tǒng)

5.可靠的副作用預(yù)測

6.通過干凈的數(shù)據(jù)有效訓(xùn)練機器學(xué)習(xí)算法

7.可靠的數(shù)據(jù)驅(qū)動決策

單細胞轉(zhuǎn)錄組（scRNA-seq）數(shù)據(jù)分析

與大塊組織轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的管理一致，scRNA-seq數(shù)據(jù)也是使用受控詞匯、領(lǐng)域?qū)＜业耐�行評審和嚴格的質(zhì)量控制。此外，還應(yīng)用了最先進的細胞聚類、批次效應(yīng)消除以及細胞類型識別和注釋方法，為研究人員提供一致且可用于分析的數(shù)據(jù)概要。GENEVESTIGATOR由人類和小鼠scRNA-Seq數(shù)據(jù)組成，并提供不同的數(shù)據(jù)格式，供研究者使用喜歡的分析工具進行探索。

GENEVESTIGATOR現(xiàn)在可以使用其用戶友好的可視化工具對來自公共存儲庫的深度策劃的單細胞RNA-Seq數(shù)據(jù)進行分析。其獨特的高質(zhì)量和深度整理的數(shù)據(jù)集合使研究人員能夠了解發(fā)育和疾病的分子機制，并揭示正常和患病組織中的細胞異質(zhì)性。概要中一致的處理、管理、聚類、細胞類型識別和研究協(xié)調(diào)使用戶能夠節(jié)省時間和資源，并專注于解決跨越不同治療領(lǐng)域的令人興奮的問題。

1.獲得全球范圍內(nèi)單細胞異質(zhì)性的高分辨率視圖

2.揭示復(fù)雜和稀有的細胞群

3.追蹤不同細胞譜系在發(fā)育過程中或?qū)Υ碳さ姆磻?yīng)軌跡

4.揭示細胞類型水平的調(diào)控關(guān)系以改進靶標發(fā)現(xiàn)

5.確定細胞類型特定疾病與生物標志物開發(fā)的關(guān)聯(lián)

6.可靠的數(shù)據(jù)驅(qū)動決策

GENEVESTIGATOR以下領(lǐng)域的數(shù)據(jù)可用，每個領(lǐng)域都包含基線開創(chuàng)性研究和更具體的研究：

1.心血管系統(tǒng)

2.消化和內(nèi)分泌系統(tǒng)

3.免疫系統(tǒng)

4.神經(jīng)系統(tǒng)

5.腫瘤學(xué)

6.生殖和腎臟系統(tǒng)

7.呼吸系統(tǒng)

8.各種系統(tǒng)（目前有來自骨關(guān)節(jié)炎、皮膚科等的數(shù)據(jù)）

【點擊查看】GENEVESTIGATOR案例：對10x RNA-Seq數(shù)據(jù)集的分析

【點擊查看】GENEVESTIGATOR：單細胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)分析

講座主題：

利用GENEVESTIGATOR探索組織和單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中的基因表達譜

講座時間：

5月22日（周三）16:00-17:00

主講嘉賓：

Frank Staubli博士

軟件介紹：

GENEVESTIGATOR是基因表達的高性能搜索引擎。它集成了上萬由專家人工統(tǒng)一精選、注釋與歸一化的公共大塊組織和單細胞實驗結(jié)果，將基因在不同的生物環(huán)境中，如疾病、藥物、組織部位、腫瘤、細胞系或基因型中的表達進行了可視化，以探索不同生物環(huán)境下不同基因的表達情況以及基因與生物環(huán)境的潛在深層聯(lián)系。

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