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基因型鑒定試劑盒使用說明書

瀏覽次數:3594 發布日期:2019-7-29  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負
試劑盒成分
 
1、 YSY Buffer
 
2、2*PCR Master Mix(使用實驗室常用的酶即可,由客戶自備)
 
儲藏條件:4oC
實驗步驟
 
1、細胞與動物組織的準備:
 
1.1 培養細胞準備:
 
以培養密度為 1´106 個/ml 為例,在超凈臺內取 1ml(內含 300-1000 個細胞);對于某些類貼壁細
 
胞,可直接刮取側壁細胞,植入已編號的 PCR 管內。
 
  • 血液準備:
 
取適當部位,采集血液 1 ml。
 
       注意:如果樣品在 10 分鐘內處理,則無需抗凝處理;在高通量采樣情況下,如果樣品在塑料PCR管內需存放 10 分鐘以上,需采用抗凝處理。
 
1.3 哺乳動物組織準備:
 
采集相應部位,剪取 1mm31 ml左右組織放入已編號的 PCR 管內。
 
1.4 斑馬魚尾鰭、果蠅等其他模式動物組織準備:
 
選取尾鰭、翅膀等無損害部位,可通過剪取、穿孔或針刺等方法制備少量新鮮組織,體積約 1mm3
 
即 1 ml
 
2、基因組 DNA 模板的制備
 
  • 加樣
  • 10ml 的 YSYBuffer 液分別逐一加入裝有組織或細胞的 PCR 管壁(注意勿將槍頭碰到組織
 
 
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樣品,防止污染);加樣完畢后,將 PCR 管快速離心,確保溶液和組織或細胞均位于 PCR 管
 
底部;
 
  • 制備基因組模板
 
  • PCR 管放入 PCR 儀中,啟動 PCR 程序:65℃×30min、95℃×5min、16℃×1min。基因組
 
模板若不立即使用,請放入-20℃保存。
 
3、目標基因的 PCR 擴增(以下試劑請自備)
 
3.1 取用新的 PCR 管,按下列順序組裝 PCR 反應體系:
 
20 m反應體系(產物直接凝膠電泳進行基因型鑒定用)
 
基因組 DNA 模板(步驟 2.2 所得):1 ml
 
2 × PCR Master Mix:10 ml(自備)
 
正向引物(5mM): 1ml (自備)
 
反向引物(5mM): 1ml (自備)
 
超純水:   7 ml(自備)
 
  • 組裝完畢后,將 PCR 管快速離心,確保所有溶液均位于 PCR 管底部;
 
  • 將 PCR 管放入 PCR 儀中,啟動客戶自行設計的 PCR 程序完成 PCR 擴增。
 
4、PCR 產物驗證
 
取 2ml 擴增產物進行瓊脂糖凝膠電泳進行基因型鑒定;若需進一步測序,可將余下的產物直接送測
 
序;若需酶切鑒定,則在經 PCR 產物純化試劑盒純化后,用核酸酶內切酶進行酶切鑒定。
 
注:測序公司一般額外收取 5 元錢的切膠費用,請在送測前和測序公司確認無需切膠回收。
 
5、結果閱讀(基因突變及突變率分析)
 
如果基因型可由引物特異性識別,則通過將觀測 PCR 產物電泳結果確定基因型;通過測序確定基
 
因型的,其測序結果可通過人工閱讀測序的色譜圖,識別突變等位基因的基因型,確定突變率。核
 
酸內切酶酶切結果可通過對凝膠電泳條帶的灰度分析,確定突變率。

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