2020 年 2 月 9 日,中國工程院院士、新型冠狀病毒肺炎疫情聯防聯控工作機制科研攻關專家組組長鐘南山院士團隊、李蘭娟院士團隊、武漢市金銀潭醫院、武漢市中心醫院、黃岡市主要醫院、浙江大學附屬第一醫院、香港中文大學醫學與治療學系等一線臨床醫院和研究機構聯合在預印本平臺 medRxiv 發表了題為Clinical characteristics of 2019 novel coronavirus infection in China 的文章。研究匯總了全國 31 個省市,共 552 家醫院的 NCP 患者病例資料,納入了從發病到 1 月 29 號共計 1099 例確診的 2019-nCoV 感染 NCP 患者。(文章地址
https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.06.20020974v1.full.pdf)
一線的研究數據、高水平的研究團隊、大規模的共享樣本數據分析、及時的信息披露等等,無論從哪個角度來看,這篇論文都具有極高的科研價值。本篇論文得出以下結論:潛伏期最長可達 24 天,尿液、糞便中都能找到新型冠狀病毒,初診時僅有 43.8% 的病人有發熱癥狀……
通過對鐘院士文章的理解,我們可以發現在本次研究過程中,大樣本數據共享和建立數據集在進行疫情精準防控分析中起到重要作用。樣本數據共享的價值在于:通過不同機構之間進行樣本數據共享,集中形成大樣本數據。對大樣本數據從不同維度進行數據挖掘,發現新冠病毒的統計性信息特點,為公眾提供完整、連續、準確、及時的防疫策略,為醫護人員提供追溯疾病源頭的方法,為決策者提供傳染病發展的有效數據和依據。
本論文為回顧性研究,為什么要做回顧性研究?分析可以分為以下兩點:①單一機構樣本數據量不足,不能支撐研究需要,所以幾家單位聯合研究;②無可用數據集,導致數據分析緩慢,結果難匯總。基于以上兩點,做了回顧性研究。當然,如果有一個平臺,能夠實現數據實時共享,那么研究者還可以進行大樣本數據的階段性實時研究,為疫情防控工作提供指導。
(來源:科技部官方網站)
日前,科技部也做出了明確指示:要求科技人員大力弘揚科學家精神,樹立大局觀念,增強社會責任感,以“功成不必在我”的胸襟,發揮集智攻關、團結協作的優良傳統,加強有關實驗數據、臨床病例、流行病學統計等數據、成果的開放共享,共同做好防控新型冠狀病毒肺炎的科技應對工作。
2019年9月4日,中華醫學會呼吸病學分會-2019(CTS2019)在湖北武漢召開,鐘南山院士在全體大會上做了《大數據視角下的呼吸疾病防控》的報告。
2020年1月29日的新聞發布會上,世界衛生組織傳染病流行病學家Maria Van Kerkhove也表示:“共享病毒至關重要。”
2020年2月5日,《自然》雜志在評論欄目發表官方聲明,呼吁全球的研究者們聯合起來,將與疫情相關的所有數據和研究成果及時公開,并承諾將發表的相關研究立即與世界衛生組織共享。
既然大樣本的數據共享對科研價值如此之大,大樣本數據共享平臺也就顯得尤為重要。作為生物樣本庫行業耕耘已久且青島市首家科創板上市的物聯網生物科技公司,海爾生物醫療生物樣本庫團隊,結合近十余年來全國700余座生物樣本庫建設運營的實際經驗,為解決各生物樣本庫“信息孤島”的行業痛點,結合科研工作者的實際需求,迭代了BIMS系統(海爾生物樣本信息管理系統),同時基于區塊鏈技術,采用數據驅動、智能合約保障的模式,打造了具有五大特色的“
生物樣本信息共享生態服務平臺”(以下簡稱“平臺”,官方網址
http://ubiobank.haierbiomedical.com/#/home):
一、平臺通過區塊鏈技術強化數據校驗,避免低效數據流轉共享。例如,平臺通過不同技術手段對樣本共享數據進行多方數據校驗,從樣本源上切實保障數據質量,為后續的數據流轉應用奠定良好基礎;
二、平臺利用區塊鏈技術,切實加強數據安全和質量保護,提升保護樣本源隱私,加強安全規范。堅守兩個原則:“脫敏原則”,發布內容要“經過特殊算法處理,脫敏私密信息”,“非必要不公開原則”;
三、平臺打破樣本數據“孤島”,高效運轉數據,加強合作機構之間交流互動,加速數據整合,提升科研產出效率;
四、平臺擁有樣本、數據、物流、檢驗等多種服務資源,面向醫療、生物、制藥、科研、醫學教育等領域的用戶,提供項目合作及生態服務(樣本存儲、樣本轉運、樣本檢測、設備租賃、科研項目合作等),在科學研究、技術轉化和成果應用領域提供完整的線上線下支持,打造生物科研領域的生態體系。
五、平臺提供上億份級樣本資源供廣大科研工作者檢索,整合國內樣本庫資源,提供精準檢索服務,為科研合作方搭建快速合作橋梁,發揮生物樣本資源的科研價值、社會價值。
另外還有科研資訊專欄、明星生物樣本庫展示、權威專家直播、行業通知公告、技術標準展示等功能;平臺線下定期舉辦科研學術沙龍活動,共同探討生物樣本科研應用新方向,加強科學家之間的合作交流。
面對這場席卷全國疫情風暴,平臺將強化跨單位、跨學科的樣本數據共享,提升樣本數據資源的整合效率,加快樣本數據集成分析的速度,形成數據、模型及數據集三維一體化,切實實現數據共享、科研共享、成果共享,為科研加油提速,為人類大健康貢獻力量。
附3:公眾號二維碼
附4:BIMS及樣本庫示例