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泛腫瘤800 gDNA標準品帶你了解兩大平臺檢測結果差異

瀏覽次數:2616 發布日期:2020-5-18  來源:菁良基因

2019年,菁良基因重磅推出了泛腫瘤800 gDNA標準品,該產品專為滿足檢測機構日常質控而研發,涵蓋了多種腫瘤類型如肺癌、結直腸癌、乳腺癌、血液病等,一經推出,即受到廣大用戶的關注和歡迎。

 

作為全球最大腫瘤基因檢測標準品,為了滿足檢測機構多種平臺不同方法下標準的統一性,菁良基因對該產品進行了多平臺方法比較供用戶參考。

 

菁良選擇了市面上常用的進口檢測Illumina平臺X10、和MGISEQ-2000RS測序平臺搭配,CoolMPS 高通量測序試劑套裝 (MGISEQ-2000RS FCL PE100)進行驗證。

 

700X WES

 

Illumina:Illumina 測序平臺,X10

MGI: MGISEQ-2000RS,CoolMPS 高通量測序試劑套裝 (MGISEQ-2000RS FCL PE100)
 


結果表明,Q30,mapping rate,coverage結果在國內外兩大平臺的表現基本一致,兩次結果下MGI平臺的duplication更低。

 

GENE

 

將ddPCR驗證過的其中13個位點單獨列出來分析,在相同測序深度情況下,兩個平臺檢測準確率差別不大,甚至MGI平臺搭配CoolMPS測序試劑能檢測出的突變位點更多。
 

 

 

菁良基因泛腫瘤800

 


產品特點

☆樣本來源于人類細胞系

☆覆蓋多種癌癥有關變異位點

☆驗證位點多(大于320個基因、720個突變)

☆變異類型全

☆變異位點多為已知數據庫位點

☆突變位點頻率范圍寬(1-100%)

☆ddPCR驗證位點突變頻率呈梯度(1-7%)

☆變異位點分布范圍廣

☆多種平臺驗證變異位點

☆全外顯子測序采用業內公認度極高的捕獲芯片及測序平臺

☆涵蓋位點包含多個國際知名腫瘤檢測Panel

 

GeneWell
 


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