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新冠肺炎檢測診斷方法的差異分析

瀏覽次數:1642 發布日期:2020-5-27  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負
2019年冠狀病毒病(COVID-19)的大流行繼續影響著世界大部分地區。對新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)診斷檢測的認識仍在不斷發展,對各類檢測性質的清楚認識和對其結果的解讀十分重要。
 

▲詳見https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2765837

近日,《JAMA》發表了一篇觀點性文章,描述了如何解讀2種常用于SARS-CoV-2感染的診斷檢測——逆轉錄酶-聚合酶鏈反應(RT-PCR)和IgM和IgG酶聯免疫吸附試驗(ELISA),以及其檢測結果如何隨時間變化。
 
▲SARS-CoV-2診斷檢測與COVID-19發生發展的動態關系


估計的時間間隔和病毒檢測率是基于一些已發表報告的數據。由于研究值的差異性,圖中估計的時間間隔應被認為是近似值,僅定性地給出了SARS-CoV-2感染的可能檢測概率。
a 只有在患者從暴露時開始主動隨訪的情況下,才會開展檢測。
b 鼻咽拭子的PCR結果更可能為陰性,而不是陽性。

病毒RNA的RT-PCR檢測
迄今為止,診斷COVID-19最常用和最可靠的檢測方法是基于鼻咽拭子或其他上呼吸道樣本(包括咽拭子或最近采用的唾液)的RT-PCR檢測。不同的制造商使用不同的RNA基因靶點,大多數檢測針對病毒包膜(env)、核衣殼(N)、刺突糖蛋白(S)、RNA依賴性RNA聚合酶(RdRp)和ORF1基因中的一個或多個。根據一些比較性研究,除了RdRp-SARSr (Charité)引物探針可能由于反向引物的不匹配而具有稍低的敏感性外,RT-PCR檢測對不同單個基因的敏感性是相當的。

在大多數有癥狀的SARS-CoV-2感染者中,鼻咽拭子中的病毒RNA在癥狀出現的第1天就可以檢測到,并在癥狀出現的第1周內達到高峰。RT-PCR的循環閾值(Ct)指產生熒光信號所需的復制周期數,較低的Ct值代表較高的病毒RNA載量。臨床報告Ct值小于40為PCR陽性。RT-PCR檢測的陽性率在第3周開始下降,隨后變得不可檢測。

然而,重癥住院COVID-19患者的Ct值低于輕癥患者的Ct值,并且可能在發病3周后仍持續表現為PCR檢測陽性,而大多數輕癥患者則呈陰性結果。值得注意的是,PCR結果呈“陽性”僅反映檢測到病毒RNA,并不一定表示存在活病毒。
在某些情況下,即使在第一次檢測呈陽性的6周之后,仍可通過RT-PCR檢測到病毒RNA。少數病例在24小時連續兩次PCR檢測呈陰性后也轉為呈陽性。尚不清楚這是否是檢測錯誤、再次感染或再次激活。

▶ 在一項對9名COVID-19患者的研究中,在發病的第8天之后,研究人員未能從培養基中分離病毒,這與發病第1周之后病毒感染性的下降有關。

這就是為什么美國疾病控制和預防中心(CDC)就“醫護人員何時可以重回工作崗位”提出了“基于癥狀的策略”建議:
“在恢復后至少3天(72小時)達到未使用退燒藥的真正退燒;并且呼吸系統癥狀(如咳嗽、呼吸急促)得到改善;并且自首次癥狀出現至少已過去10天。”

其他樣本的PCR陽性時間線與鼻咽拭子不太相同。

▶ 在一項研究中,96名受感染者中有55名(57%)的糞便樣本檢測出PCR陽性,而在鼻咽拭子呈陰性后,在4-11天的中位數期間其糞便PCR仍保持陽性,但與臨床嚴重程度無關。

▶ 有研究發現,痰和糞便中PCR陽性持續時間相似。痰中PCR陽性率下降較慢,在鼻咽拭子陰性后仍可能為陽性。

▶ 另一項研究發現,在205例確診為COVID-19的患者中,RT-PCR陽性率最高的是支氣管肺泡灌洗標本(93%),其次是痰(72%)、鼻拭子(63%)、咽拭子(32%)。

假陰性結果主要是由于與發病有關的采樣時機不當和采樣技術不當,尤其是鼻咽拭子。大多數RT-PCR檢測的特異性為100%,這是因為引物設計對SARS-CoV-2的基因組序列具有特異性。由于技術錯誤和試劑污染,偶爾會出現假陽性結果。

SARS-CoV-2的抗體檢測
SARS-CoV-2感染也可以通過檢測宿主對SARS-CoV-2感染的免疫反應被間接檢測到。血清學診斷對于輕到中度COVID-19患者尤其重要,這些患者可能在發病兩周之后可被檢出。血清學診斷也正在成為了解社區中COVID-19傳播范圍和識別潛在“已獲得免疫通行證”個體的重要工具。

最敏感和最早的血清學標志物是總抗體,其水平從癥狀出現的第2周開始升高。雖然IgM和IgG-ELISA早在癥狀出現的第4天就被發現呈陽性,但在疾病的第2周和第3周才呈較高水平。

▶ 例如,根據兩項分別對23名COVID-19患者和85名患者的檢測,所有患者在臨床發病的第3周和第4周之間都發生了IgM和IgG血清轉化。此后,IgM開始下降,到第5周達到較低水平,到第7周幾乎消失;而IgG持續超過7周。

▶ 在一項140例患者的研究中,PCR和IgM-ELISA聯合檢測核衣殼(NC)抗原的敏感性達到98.6%,而單獨PCR檢測僅51.9%。在發病的最初5.5天,定量PCR的陽性率高于IgM,而IgM-ELISA在發病的第5.5天后的陽性率更高。

基于ELISA的IgM和IgG抗體檢測對COVID-19的診斷具有95%以上的特異性。首次PCR檢測和2周后進行配對血清樣本檢測,可進一步提高診斷準確率。

通常,大多數抗體都是針對SARS-CoV-2中最豐富的核衣殼蛋白(NC)。因此,針對NC抗體的檢測將是最敏感的。然而,S蛋白的受體結合域(RBD-S)是宿主附著蛋白,抗RBD-S的抗體將更具特異性,有望成為中和抗體。因此,用上述一種或兩種抗原檢測IgG和IgM具有較高的敏感性。不過,抗體可能與非典冠狀病毒(SARS-CoV)和其他冠狀病毒有交叉反應。

抗體的即時/床邊快速檢測已經得到廣泛的商業化開發,但質量參差不齊。許多制造商沒有透露所用抗原的性質。這些檢測本質上是純定性的,只能表明是否存在SARS-CoV-2抗體。

中和抗體的存在只能通過菌斑減少中和測試來證實。不過,ELISA檢測到的IgG抗體的高滴度被發現與中和抗體呈正相關。中和抗體的長期持久性和保護期尚不清楚。

展望
研究利用現有證據,設計了檢測COVID-19的診斷標記物的臨床時間線。大多數可獲得的數據是針對沒有免疫受損的成年人群的。PCR陽性和血清轉化的時間進程在兒童和其他人群中可能有所不同,包括大量無癥狀個體在沒有積極監測的情況下未被診斷。
許多疑問仍待解決,特別是在感染SARS-CoV-2的無癥狀和有癥狀的個體中,潛在免疫力能持續多久?

先達基因成功完成ERA法新型冠狀病毒快速檢測試劑盒開發
應對疫情,蘇州先達基因科技有限公司迅速反應、正面抗擊!目前已成功研制出新型冠狀病毒2019-nCoV核酸檢測試劑盒,通過實驗檢測,可在反應20分鐘內得出結果,8~15分鐘即可對1000到100拷貝數的病毒基因給出結果判斷。

樣品檢測結果:
 
圖1:先達基因GS8熒光檢測儀檢測結果
編號 不同濃度樣本 判定時間 Δ熒光值 結果
A1 2×106 4min 15000 強陽
A2 2×105 4.5min 16000 強陽
A3 2×104 5.5min 15700 強陽
A4 2×103 7.5min 12500 強陽
A5 2×102 8min 8000 強陽
A6 2×101 14.5min 850 弱陽
A7 NTC - <50 陰性
 
表1:先達基因GS8儀器檢測結果分析
 
蘇州先達基因是一家致力分子檢測與診斷領域核酸快速檢測產品研發的企業,公司研發的低溫快速核酸檢測技術(ERA技術),它具有低溫適應性,而且在反應速度、靈敏度、準確性等方面有了極大的突破。該技術在低溫條件下(25-42℃)可對極微量的病原體的基因片段進行特異性的快速擴增,10-15分鐘可將目標基因片段精準復制數十億倍,只需20 min,就能完成現場檢測并出具報告,極大縮短了檢測時間。

由于時間緊迫,先達基因“新型冠狀病毒2019-nCoV核酸檢測試劑盒(RT-ERA熒光檢測法)”,目前僅為科研類產品。先達基因科技有限公司愿與有擔當的企業或科研院所一起向藥品監督管理部門提出醫療器械應急審批申請,并將產品提供給各級疾控部門和醫療機構檢測使用,幫助政府和衛生部門防控篩查潛在新型冠狀病毒感染患者,控制疾病傳播。
發布者:蘇州先達基因科技有限公司
聯系電話:0512-68439557
E-mail:sales@gendx.cn

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