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逆轉(zhuǎn)錄酶與Taq DNA聚合酶的特點(diǎn)及應(yīng)用介紹

瀏覽次數(shù):5191 發(fā)布日期:2022-4-28  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
酶是一類極為重要的生物催化劑,具有催化高效性和反應(yīng)特異性。絕大多數(shù)生化反應(yīng)均需要酶的參與,核酸檢測(cè)也不例外。不同類型的分子酶在核酸檢測(cè)的不同實(shí)驗(yàn)階段發(fā)揮了重要的作用。

一、逆轉(zhuǎn)錄酶,分享該酶的特點(diǎn)和應(yīng)用
逆轉(zhuǎn)錄(reverse transcription)是以RNA為模板合成DNA的過程,即RNA指導(dǎo)下的DNA合成。此過程中,核酸合成與轉(zhuǎn)錄(DNA到RNA)過程與遺傳信息的流動(dòng)方向(RNA到DNA)相反,故稱為逆轉(zhuǎn)錄。逆轉(zhuǎn)錄過程由逆轉(zhuǎn)錄酶催化。

大多數(shù)逆轉(zhuǎn)錄酶都具有以下幾種活性。
①DNA聚合酶活性;
以RNA為模板,催化dNTP聚合成DNA的過程。逆轉(zhuǎn)錄酶的合成能力決定了產(chǎn)生的cDNA鏈的長短,一些基因工程改造的MMLV逆轉(zhuǎn)錄酶在單個(gè)結(jié)合位點(diǎn)中可以結(jié)合多達(dá)1,500個(gè)核苷酸,結(jié)合能力大概是野生型MMLV逆轉(zhuǎn)錄酶的65倍。

逆轉(zhuǎn)錄酶中不具有3'→5'外切酶活性,因此沒有校正功能,所以由逆轉(zhuǎn)錄酶催化合成的DNA出錯(cuò)率比較高,基于MMLV的逆轉(zhuǎn)錄酶錯(cuò)誤率在合成15,000到27,000個(gè)核苷酸中有一個(gè)錯(cuò)誤核苷酸。

②RNase H活性;
由逆轉(zhuǎn)錄酶催化合成的cDNA與模板RNA形成的雜交分子,將由RNase H從RNA 5'端水解掉RNA分子。但是RNase H活性的存在可能降低逆轉(zhuǎn)錄效率,所以工程化的逆轉(zhuǎn)錄酶,通常會(huì)降低甚至消除RNase H活性,以提高cDNA合成效率。

③DNA指導(dǎo)的DNA聚合酶活性;
以逆轉(zhuǎn)錄合成的第一條DNA單鏈為模板,以dNTP為底物,再合成第二條DNA分子。

除此之外,工程化的逆轉(zhuǎn)錄酶都具備一定的溫度耐受性,有助于使具有堅(jiān)固二級(jí)結(jié)構(gòu)和/或高GC含量的RNA變性,使得逆轉(zhuǎn)錄酶能夠讀取序列,增加cDNA合成長度,提高合成效率。

GenFQ III Reverse Transcriptase是經(jīng)過基因工程改造的新一代逆轉(zhuǎn)錄酶,大幅提高了熱穩(wěn)定性,無RNase H活性。可以在42-55℃(高溫有利于打開RNA二級(jí)結(jié)構(gòu))條件下合成第一鏈cDNA,最佳反應(yīng)溫度為50℃。具有靈敏度高、特異性高、聚合能力強(qiáng)、 熱穩(wěn)定性強(qiáng)和半衰期長特點(diǎn)。該酶增強(qiáng)了與模板的親和力,適合少量模板以及低拷貝基因的逆轉(zhuǎn)錄。

合成效率為95.1%,證明cDNA的合成效率較高,而且RNA梯度稀釋線性關(guān)系良好。
 

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熱穩(wěn)定能力強(qiáng),熱穩(wěn)定7d對(duì)反轉(zhuǎn)錄效率無影響
 
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二、Taq DNA聚合酶
PCR技術(shù)改變了現(xiàn)代分子生物學(xué),而Taq DNA聚合酶改變了PCR。Taq DNA聚合酶是一種從Thermus aquaticm分離出的耐熱型DNA 聚合酶,主要應(yīng)用在直接PCR、等位基因檢測(cè)、Sanger測(cè)序、TA克隆等領(lǐng)域。
 
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Taq DNA聚合酶改具有良好的耐熱型,最適催化溫度在75-80℃,95℃半小時(shí)后仍保留50%以上的活性。Taq DNA聚合酶是少數(shù)具有5'-3'外切核酸酶活性的DNA聚合酶之一。能夠切除5’端放射性標(biāo)記的DNA探針,通過放射性信號(hào)的變化,實(shí)現(xiàn)PCR產(chǎn)物的特異性檢測(cè)。
 
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但是普通的Taq DNA聚合酶22°C時(shí)仍然有很低速的核酸合成,大約為0.25核苷/秒/酶分子,也就是說引物還沒有正常配對(duì),而酶已經(jīng)催化了合成,會(huì)產(chǎn)生非特異性擴(kuò)增。
 
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基于Taq DNA聚合酶開發(fā)的熱啟動(dòng)Taq DNA聚合酶,利用酶的修飾物在常溫下抑制DNA聚合酶的活性,加熱到變性溫度時(shí)修飾物失活,酶活得以釋放,從而使PCR反應(yīng)正常進(jìn)行,解決了PCR反應(yīng)中引物二聚體產(chǎn)生或錯(cuò)配引起的非特異性擴(kuò)增等問題,提高了PCR反應(yīng)的特異性。
 
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濟(jì)凡生物Flash Robust HotStart DNA Polymerase (A210)是基于野生型Taq DNA聚合酶定向化改造得到的新型熱啟動(dòng)酶,采用雙抗體封閉,有效防止錯(cuò)配或引物二聚體引起的非特異性擴(kuò)增,有效抑制探針降解產(chǎn)生的熒光信號(hào)下降,具有超高的擴(kuò)增效率、較高的擴(kuò)增靈敏度(可達(dá)個(gè)位拷貝數(shù)擴(kuò)增)和特異性,具有較強(qiáng)的血液及PCR抑制劑耐受性。適用于各種基于Taq DNA Polymerase的熱啟動(dòng)PCR、qPCR反應(yīng),可用于從復(fù)雜模板(基因組和cDNA)中擴(kuò)增低拷貝基因,可用于血液直擴(kuò)等直接擴(kuò)增PCR。
 
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以非瘟質(zhì)粒為模板,進(jìn)行9個(gè)10倍梯度稀釋,第9個(gè)稀釋梯度中質(zhì)粒拷貝數(shù)濃度約為6 copies/2μl。對(duì)各稀釋梯度進(jìn)行檢測(cè),每孔模板使用量為2μl。可以看到,A210在寬廣的模板量區(qū)間內(nèi)具有優(yōu)秀的線性關(guān)系,可以輕松檢測(cè)出個(gè)位數(shù)拷貝的待測(cè)模板。
發(fā)布者:濟(jì)凡生物科技(北京)有限公司
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