生物體內有超過三分之一的蛋白可以發生磷酸化修飾，是目前研究認知程度較高也是研究選擇較多的翻譯后修飾。普遍參與信號傳遞與信號調控過程，在藥物靶點開發、腫瘤發病機制研究、植物生長發育與脅迫等領域中發揮重要作用。涉及磷酸化修飾的相關發文數量近幾年也非常多，那么各位科研小伙伴在研讀磷酸化修飾相關的文章時，是否發現文章中很多會涉及激酶分析的相關內容呢？那么何謂激酶以及激酶分析中又有哪些關鍵內容對于文章深度有重要影響呢?
 

激酶分析重要性

激酶(kinase)是一類將高能供體分子(如ATP)的磷酸基團轉移到特定靶分子(底物)的酶，其中最大的激酶族群是蛋白激酶。蛋白激酶作用于特定的蛋白，改變蛋白活性，在臨床上激酶常被作為診斷、藥物研發及疾病靶向治療的目標靶點。但是激酶分析相對難度較大，涉及到激酶數據庫的選擇、激酶活性預測、激酶與底物尋找、激酶藥物靶點注釋等多元化分析內容，不僅需要用到的分析方法多，而且需要具備較深的背景知識，這也大大提高了磷酸化數據深度挖掘的難度。

 

中科新生命激酶分析完整解決方案

近期中科新生命針對激酶分析內容進行了進一步的升級，不僅可無縫銜接多種磷酸化修飾定量組學（4D-Labelfree磷酸化、DIA磷酸化、TMT磷酸化、磷酸化+蛋白聯合分析），而且增加了多項激酶分析內容，現在隨小編來一一揭示激酶分析的升級亮點。

 

亮點一

突破激酶分析物種限制---線蟲、果蠅、擬南芥、小麥、水稻、玉米、番茄也可進行激酶注釋

原有激酶分析只是在大鼠、小鼠和人物種上。此次升級，通過參考數據庫的擴展和大量數據測試，大大突破了物種的限制，多種物種，包括線蟲、果蠅、擬南芥、小麥、水稻、玉米、番茄均可進行激酶注釋。

 

亮點二

激酶功能分析全面提升---GSEA分析激酶介導的關鍵信號通路

對激酶的分析，首先要從功能上對其進行深入的解析，尋找激酶影響的磷酸化修飾蛋白所介導的關鍵信號通路。

磷酸化修飾組中通常采用KEGG、GO富集分析獲取差異磷酸化肽段所屬蛋白顯著富集的通路和功能，但無法知曉某條通路下差異磷酸化蛋白的總體變化趨勢，以及對應通路的狀態（通路到底是激活還是抑制）。此外，設置差異磷酸化肽段篩選閾值可能會漏掉一些在統計學意義上無顯著差異但實際有著重要生物學意義的蛋白。

此次升級，采用GSEA對于所有磷酸化肽段進行分析，找到差異不顯著但磷酸化蛋白差異表達趨勢趨于一致的功能基因集，同時還能夠直觀判斷對應通路是處于被激活或抑制狀態。具體GSEA分析如下圖所示。

 

亮點三

激酶作用分析進一步升級---激酶注釋、活性分析和激酶-底物互作分析

激酶的活性狀態對于調控磷酸化修飾水平至關重要，本次升級，采用KSEA和GSEA對激酶活性狀態進行分析和深度挖掘，便于篩選目標激酶。此次升級的分析內容如下圖所示。
 

 

亮點四

激酶臨床轉化分析的升級---激酶藥物靶點注釋

自20世紀80年代以來，激酶一直被認為是潛在的藥物靶點，特別是基于對癌癥的進展。目前已有數百種激酶抑制劑開發出來并在人類身上做了測試。

此次升級通過整合多種藥靶數據庫對激酶進行了注釋，分析激酶中哪些已經成為/還未成為藥靶、以及激酶對應藥物的情況，便于老師進行藥物靶點以及相關抑制劑的快速篩選。下圖為結果示例：

 

人類蛋白激酶組可按結構域序列間的相似性劃分為不同的group，在激酶樹上根據不同激酶的進化距離可繪制激酶樹。此次升級中，我們整理了詳細的方法助力各位老師繪制激酶樹。

 

【中科新生命】4D-Labelfree磷酸化、TMT磷酸化的促銷活動正在進行中，促銷期間下單磷酸化修飾組免費送升級后的激酶分析。歡迎感興趣的老師前來咨詢。