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Trziol法提取RNA所需試劑耗材及實驗操作流程

瀏覽次數(shù):3375 發(fā)布日期:2023-2-13  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負

隨著分子生物技術(shù)在生物學(xué)、醫(yī)學(xué)等方面的廣泛應(yīng)用,RNA提取已成為研究基因表達、克隆目的基因等的一項基本試驗技術(shù)。高質(zhì)量RNA的提取,是后續(xù)RT-PCR、qPCR、Northern blot、cDNA文庫構(gòu)建等正常進行的必要前提。Trizol法是一種常見的提取總RNA的方法,在RNA得率及試劑成本方面具有一定的優(yōu)勢。
 

圖1 Trizol法提取RNA流程


Trizol是一種較為流行的總RNA抽提試劑,可以直接從細胞或組織中提取總RNA。其含有苯酚、異硫氰酸胍等物質(zhì),能迅速破碎細胞并抑制細胞釋放出的核酸酶,因此對于純化RNA及標(biāo)準(zhǔn)化RNA的生產(chǎn)來說使用價值極高。

 

Trziol法提取RNA所需試劑耗材清單
 


圖2

 

01 / Trizol
♦ Trizol是動植物細胞、組織或者細菌的總RNA抽提試劑
♦ 主要含有苯酚、異硫氰酸胍等物質(zhì),能迅速破碎細胞并抑制細胞釋放出的核酸酶。苯酚主要用于裂解細胞、變性蛋白,同時使部分RNase失活,保護RNA;異硫氰酸胍可降解細胞、溶解蛋白質(zhì),使蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)消失、使核蛋白與核酸分離,進而使核內(nèi)的RNA被釋放出來,并且抑制RNase活性;
♦ 抽提所得RNA無DNA和蛋白污染。一般所得RNA溶于DEPC水后的A260/280值為8-2.0;
♦ 裂解細胞或和組織共勻漿時,Trizol可以保持樣品中RNA的完整性,即可以有效抑制RNA的降解
♦ 每一百萬細胞用Trizol抽提可得5-15μg RNA;每毫克組織用Trizol抽提可得1-10μg RNA,產(chǎn)量因細胞和組織不同而異;
♦Trizol抽提所得RNA可直接用于Northern,點雜交,純化mRNA,體外翻譯,RNase protectionassay,cDNA克隆,以及RT-PCR;也可以用于基因表達芯片分析、高通量測序等對RNA質(zhì)量要求較高的情況。

02 / 氯仿

氯仿是分子量比較大的有機溶劑,在提取RNA時,氯仿可以有效的使有機相和無機相迅速分離。加入氯仿,離心后,樣品即分成水樣層(RNA存在于水樣層)、中間層(DNA和蛋白質(zhì)存在于中間層)和有機層。
細化它的主要作用點:
(1)作為有機溶劑變性蛋白,使其沉淀并通過離心除去,同時也通過變性作用抑制RNase活性;
(2)RNA提取試劑中通常含有苯酚(Trizol主要成分就是苯酚),苯酚微溶于水,抽提烷之后水相里有痕量的酚,如果不除去會損傷核酸,需要通過氯仿把水相里參與的苯酚抽提掉;
(3)作為溶劑抽提樣品中的一些脂溶性雜質(zhì)(比如油脂、脂溶性色素等),起到一定除雜作用。

 

03 / 異丙醇

異丙醇的作用主要是沉淀RNA。RNA存在于水樣層中,收集水樣層后可以通過異丙醇沉淀RNA來還原。離心前沉淀不可見,離心棄上清后,可見膠狀的RNA沉淀。
 

04 / 75%乙醇

75%乙醇主要由乙醇和DEPC水配置,主要用來洗滌粘附在RNA沉淀上的氯仿跟異丙醇。
 

05 / DEPC處理水(無DNA/RNA酶)

DEPC處理水是經(jīng)DEPC(即diethyl pyrocarbonate,焦碳酸二乙)處理過并經(jīng)高溫高壓滅菌的超純水(一級水),是一種無色液體。經(jīng)檢測不含雜質(zhì)RNA、DNA、核酸酶和蛋白質(zhì)。本產(chǎn)品可以用于RNA沉淀的溶解,含有RNA的各種反應(yīng)體系,以及其它要求無RNase、DNase和proteinase的反應(yīng)體系。
 

實驗操作流程


一、細胞裂解

1、組織樣本:

Trizol用量:每50-100mg 組織加1 ml Trizol,樣品體積不應(yīng)超過Trizol體積的10%。
(1)將動物或植物組織切成小塊,在液氮中磨碎或用勻漿器勻漿處理;
(2)將研磨好的組織粉末快速轉(zhuǎn)入裝有1ml Trizol的2 ml離心管中,在渦旋振蕩器上迅速振蕩混勻,置于冰上,待所有的樣品研磨完;
(3)裂解產(chǎn)物應(yīng)呈澄清的透明粘稠液體。對于富含蛋白、脂肪或多糖物質(zhì)的組織樣品如肌肉、脂肪組織和植物結(jié)節(jié)部位等,勻漿后仍會存留有不溶物質(zhì),可于4℃ 12,000 x g 離心10min,然后吸取上清至一新的離心管中。

 

2、細胞樣本:
(1)貼壁細胞:吸盡培養(yǎng)液,每10cm2培養(yǎng)面積(6孔板單孔或35 mm平皿)加入1ml Trizol,用加樣器吹打數(shù)次,以確保細胞完全裂解,然后轉(zhuǎn)移至離心管中。注:Trizol的使用量應(yīng)由培養(yǎng)皿表面積決定,而非由細胞數(shù)目決定。Trizol量不足可能導(dǎo)致提取的RNA中有DNA污染;
(2)懸浮細胞:離心收集細胞,吸盡液體,每 5-10×106動植物或酵母細胞,或每 1×107細菌細胞加入1ml Trizol,用加樣器吹打,使其完全裂解,然后轉(zhuǎn)移至離心管中。

注:添加Trizol前切勿洗滌細胞 ,以免RNA降解。必要時可以用勻漿器來裂解某些細菌或者酵母細胞。
 

二、液相分離

(1)裂解產(chǎn)物于室溫放置5min,使核酸-蛋白復(fù)合物完全分離;(注:此時樣品可在-80℃長期保存。)
(2)每1ml Trizol加入0.2ml氯仿,蓋緊管蓋,劇烈振蕩15s,室溫放置2-3min;
(3)4℃ 12,000 x g離心15min,樣品會分成三層:桔黃色的下層有機相,中間層和無色的上層水相;
(4)吸取含總RNA的上層水相至一新的離心管中,吸取水相的體積為所用Trizol試劑的60%。

 

三、RNA回收

(1)按照每1ml Trizol的最初使用量加入0.5ml異丙醇,顛倒數(shù)次混勻,室溫放置10min;
(2)4℃ 12,000 x g 離心10min,棄除上清,可見膠狀的RNA沉淀;
(3)按照每1ml Trizol的最初使用量加入1ml 75%乙醇,顛倒數(shù)次混勻,洗滌沉淀;
(4)4℃ 12,000 x g離心5min,棄除上清;
(5)室溫倒置5-10min晾干或真空抽干(不要使用真空干燥離心機,以免RNA過干,難以溶解);
(6)加入適量(如25ul)DEPC-ddH2O或TE緩沖液,用加樣器吹打數(shù)次溶解RNA;
(7)通過RNA電泳以及紫外分光光度計檢測,確定RNA的濃度、純度和完整性;
(8)所得的RNA應(yīng)立即使用或適量分裝后-80℃保存,避免反復(fù)凍融。

發(fā)布者:愛必信(上海)生物科技有限公司
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