高通量單細胞轉錄組測序發展與展望

瀏覽次數：1248　發布日期：2021-2-2　來源：本站　僅供參考，謝絕轉載，否則責任自負

單細胞轉錄組測序技術這幾年的發展之快，運用之廣已眾所周知。為更好的在國內推廣該技術，也為更好的將該技術運用到廣大科研工作者的實際工作中，上海生物芯片有限公司生物信息團隊通過對該技術的整理和歸納，在《生命科學》雜志上發表了名為“高通量單細胞轉錄組測序發展與展望”綜述文章，希望能進一步提升科研工作者對該技術的認識和了解，以更好地將該技術發揚光大。

本綜述通過對高通量單細胞轉錄組檢測技術的發展進展，檢測技術的特點，數據分析方法等角度進行綜述，并對目前存在的問題及將來可能的發展方向進行了討論。

在第一部分，綜述對高通量單細胞轉錄組測序平臺研究進展進行了整理，這里包括單細胞轉錄組測序的基本實驗流程，技術特點，特別是現在商用比較廣泛的10X Genomics公司的微滴技術和DB的微孔技術進行了詳細描述與技術對比。

高通量單細胞轉錄組測序研究最重要的一個工作是對大數據的分析和數據挖掘，在第二部分，該綜述詳細介紹了單細胞測序數據的后續數據分析過程和常用分析方法。另外，針對單細胞轉錄組數據的特點，本文還重點闡述了細胞軌跡推演，細胞互作預測和功能富集幾種常見且具有代表性的單細胞轉錄組數據深入挖掘高級分析內容。

在第三部分，綜述重點對單細胞轉錄組測序中的常見技術問題：樣本類型選擇、多細胞率、捕獲效率、罕見亞群缺失問題進行了闡述，并根據最新的研究進展，提出了可能的解決方案。從這里，我們也可以看到，雖然每種技術方法有各種不完美的地方，但是，現在對單細胞技術的廣泛關注，也使得這些存在的問題在一步步解決。

在隨后一部分，本綜述對單細胞技術的未來發展進行了展望。單細胞轉錄組測序用于lncRNA、外泌體檢測，用于降低成本的多樣本標簽技術，空間轉錄組測序技術，三代測序用于單細胞轉錄組，單細胞多組學技術等進行了展望。我們相信，在接下來的幾年中，單細胞轉錄組研究會為科學研究帶來更多的成果和產出。