蝦虹彩病毒探針法熒光定量PCR試劑盒使用說明書
瀏覽次數:773 發布日期:2023-11-29
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產品及特點
虹彩病毒科宿主范圍廣泛,可感染脊椎動物和無脊椎動物,它們在水生物種中廣泛分布,可能導致大規模損失。它可感染四脊滑螯蝦(Cherax quadricarinatus)、凡納濱對蝦(Litopenaeus vannamei)、羅氏沼蝦(Macrobrachium rosenbergii)、日本沼蝦(Macrobrachium nipponense)、克氏原螯蝦(Procambarus clarkii)、脊尾白蝦(Exopalaemon carinicauda)、中華絨螯蟹(Eriocheir sinensis)和粗腿厚紋蟹(Pachygrapsus crassipes)等。本產品就是以探針法熒光定量PCR技術為基礎開發的專門檢測蝦虹彩病毒的試劑盒,它具有下列特點:
■ 即開即用,用戶只需要提供樣品DNA模板。
■ 引物和探針經過優化,靈敏性高。
■ 提供陽性對照,便于區分假陰性樣品。
■ 特異性高,引物是根據蝦虹彩病毒DNA高度保守區設計,不會跟其他微生物的DNA發生交叉反應。
■ 既可用于定性檢測,又可用于定量檢測。用于定量檢測時線性范圍至少為5個數量級。
■ 本產品足夠50次20μL體系的探針法熒光定量PCR反應。
■ 本產品只能用于科研。
格及成分
成分 |
編號 |
A |
190303 |
B |
180701 |
C |
100935 |
D |
15-75430yp |
E |
75430pc |
使用手冊 |
15-75430sc |
運輸及保存
低溫運輸,-20℃保存,保存期限為12個月。
自備試劑
樣品DNA。
使用方法
一、稀釋標準曲線樣品(以10E1-10E6拷貝/μL這6個10倍稀釋度為例)。由于標準品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨立的區域進行,千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分。為增加產品穩定性和避免擴散傳染性病原,本產品不提供活體樣品做陽性對照,只提供無傳染性的DNA片段作為陽性對照。
■ 標記6個離心管,分別為6,5,4,3,2,1。
■ 用帶芯槍頭分別加入45 μL熒光PCR專用模板稀釋液,最好用帶芯槍頭,下同。
■ 在6號管中加入5 μL 1×10E7拷貝/μL 的陽性對照(試劑盒提供),充分震蕩1分鐘,得1×10E6拷貝/μL的標準曲線樣品。放冰上待用。
■ 換槍頭,在5號管中加入5 μL 1×10E6拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得1×10E5拷貝/μL的標準曲線樣品。放冰上待用。
■ 換槍頭,在4號管中加入5 μL 1×10E5拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得1×10E4拷貝/μL的標準曲線樣品。放冰上待用。
■ 重復上面的操作直到得到6個稀釋度的標準曲線樣品。放冰上待用。
二、樣品DNA的制備
■ 如果有N個樣品待提取,最好設置N+2個提取,多出的是PC(樣品制備陽性對照)和NC(樣品制備陰性對照)。可以取陽性對照的1000倍稀釋液10μL再加上一定量的水,使總體積與待提取樣品的規定體積一致,以此作為PC。另外用水作為NC。
■ 用自選方法純化樣品的DNA,本試劑盒跟市場上大多數DNA提取試劑盒兼容。
三、Probe qPCR反應(20μL體系,在樣品制備室進行)
■ 如果做定量分析并且只做1次重復,則標記N+9個PCR管,其中N+2個用于上步得到的N+2個樣品,1個用于PCR陰性對照(用水做模板),6個用于標準曲線。如果做定性分析,并且只做1次重復,則標記N+4個PCR管,其中N+2個用于上步得到的N+2個樣品,1個用于PCR陰性對照(用水做模板),1個用于PCR陽性對照(用第4號管的陽性對照稀釋液做模板)。下面只以定量分析為例描述操作步驟。
■ 在標記管中按下表加入各成分(本表只列出一次重復。樣品管和陰性對照設置完畢后才設置陽性對照,并且陽性對照樣品要等所有管子蓋上蓋子儲存好后最后加):
成分/每管 |
樣品管
N+2個 |
PCR陰性對照管 |
標準曲線
樣品管(1-6管) |
A |
10 μL |
10 μL |
10 μL |
D |
3 μL |
3 μL |
3 μL |
N+2個待測DNA模板 |
7 μL |
- |
- |
C |
- |
7 μL |
- |
第6步所得標準曲線樣品稀釋液(1-6號) |
- |
- |
7 μL(1號樣到1號管,2號樣到2號管…) |
■ 蓋上蓋子后上機,按下面參數進行PCR:
過程 |
溫度 |
時間 |
預變性 |
95℃ |
10 min |
PCR反應
(45個循環) |
95℃ |
15 sec |
60℃ |
60 sec(采集FAM通道的熒光信號) |
四、數據處理
■ 如果把本試劑盒用于定量檢測,則以陽性對照濃度的log值為橫軸,以Ct值為縱軸,繪制標準曲線。再以待測樣品的Ct值從標準曲線上推算出樣品核酸濃度的log值,再推算出其濃度。
■ 如果把本試劑盒用于定性檢測,只判斷陽性或陰性,則陰性對照Ct必須大于或等于40。陽性對照必須有熒光對數增長,有典型擴增曲線,Ct值應該小于或等于39。對待測樣品,如果其Ct大于或等于40則為陰性,如果小于或等于39則為陽性。如果在39-40之間,則重復一次。重復實驗的Ct值如果大于或等于40則為陰性,如果小于40,則為陽性。