m5C RNA甲基化簡介
通過分析近幾年的國自然立項,可以發現RNA甲基化這兩年的基金項目呈指數級增長的趨勢:特別是從2015年的5項到2017年的25項,項目增長尤為顯著。僅2018年1月的RNA甲基化文獻就達到25篇,可以說RNA甲基化的發展已經到了井噴階段,多篇文章榮登CNS級別期刊。
圖: RNA甲基化歷年發文章數據
RNA甲基化是一類新認知的表觀遺傳修飾,主要包括6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A), 5-甲基胞嘧啶(C5-methylcytidine,m5C),1-甲基腺嘌呤(N1-methyladenosine,m1A)等。RNA甲基化在調控基因表達、穩定、降解等方面具有重要作用。其中,m5C RNA甲基化是一類新型的表觀轉錄組學修飾,也是最新的國際科研熱點,在非編碼RNA及部分mRNA上廣泛存在。為了系統性揭示RNA甲基化修飾,云序生物獨家首發m5C RNA甲基化測序服務,可在全轉錄組范圍內單堿基分辨率地檢測基因m5C甲基化修飾分布。
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m5C RNA甲基化文獻解析(影響因子:11.9)
這里給大家分享一篇2017年《Genome Biology》上的m5C甲基化譜文章:作者通過m5C RNA甲基化測序,發現小鼠胚胎干細胞中m5C修飾位點優先分布于mRNA起始密碼子附近,在小鼠腦組織中則傾向于分布在3'UTR區。通過生信分析對m5C修飾的RNA對應基因功能GO注釋。此外與CLIPdb的數據聯合分析發現,小鼠胚胎干細胞中大約29%的m5C RNA修飾位點與對應RBP(RNA結合蛋白)結合位點重合,顯示出與RBP結合并在特定轉錄本中發揮生物學功能的潛力。
思路圖
結果展示
圖: 胚胎干細胞和大腦組織中m5C RNA甲基化富集區域注釋
云序生物m5C RNA甲基化數據展示
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