如何快速查找LncRNA序列
查找LncRNA序列的網站有很多，包括Genebank，Ensembl，RefSeq，UCSC數據庫等。今天，小編就給大家講講如何通過LncRNA ID號查找LncRNA的序列。
一．根據LncRNA來源數據庫，進入相應鏈接。
1. Genebank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
2. Ensembl：http://asia.ensembl.org/index.html
3. RefSeq：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/
4. UCSC：http://genome.ucsc.edu/
二．根據“gene_id”查看LncRNA在所屬數據庫的ID號。
1. Genbank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
紅框內輸入gene_id號，點擊search。假設gene_id為AK009210。
點擊FASTA鍵，復制獲取序列。
2. Ensmbl：http://asia.ensembl.org/index.html
選擇物種類別，詳見Report-Sequence_Results-Supplementary（可選項）。紅框內輸入gene_id號，點擊GO。假設gene_id為ENSMUSG00000099021。
轉到Genbank，復制獲取序列。
3. RefSeq：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/
紅框內輸入gene_id號，點擊search。假設gene_id為C630043F03Rik。
點擊FASTA，獲取序列信息。
4. UCSC：http://genome.ucsc.edu/
Genomes下拉菜單選擇參考基因組，一般人類選擇hg19，鼠選擇mm10。
紅框內輸入gene_id號，點擊search。假設gene_id為Ivns1abp，點擊go。
點擊下圖的紅框。
點擊下圖的紅框。
選擇mRNA，復制獲取序列信息。
云序相關產品推薦：
m6A RNA全轉錄組甲基化測序
m5C RNA全轉錄組甲基化測序
m1A RNA全轉錄組甲基化測序
超微量RNA甲基化測序
比色法檢測整體甲基化水平
RIP
RNA Pull Down
Me-DIP測序
往期精彩回顧：
看表觀新修飾-6mA如何助力IF飆升!
10分以上m6A RNA甲基化測序文章----云序生物助力
不得了，大牛告訴你lncRNA甲基化如何研究
RNA甲基化進入超微量時代
小白必看！RNA甲基化整體水平鑒定的方法匯總
20分文章中的RNA甲基化，熱度與實力并存
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究匯總—非編碼RNA篇
云序生物最新“RNA 甲基化”研究匯總-擬南芥篇
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究匯總—病毒篇
Plant Cell：擬南芥發現全新m6A RNA去甲基化修飾酶
云序客戶12分頂級文章，教你如何巧用RIP測序玩轉分子機制！
2018年Nature雜志重磅級突破性研究成果--m5C RNA甲基化 云序生物
Nature突破性研究—RNA甲基化新修飾m1A 云序生物
Hepatology：m6A RNA甲基化酶METTL3促肝癌發展新玄機
上海云序生物科技有限公司
Shanghai Cloud-seq Biotech Co., Ltd.
地址：上海市松江區莘磚公路518號20號樓3樓
電話：021-64878766
傳真：021-64878766
網址：www.cloud-seq.com.cn
郵箱：market@cloud-seq.com.cn
一．根據LncRNA來源數據庫，進入相應鏈接。
1. Genebank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
2. Ensembl：http://asia.ensembl.org/index.html
3. RefSeq：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/
4. UCSC：http://genome.ucsc.edu/
二．根據“gene_id”查看LncRNA在所屬數據庫的ID號。
1. Genbank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
紅框內輸入gene_id號，點擊search。假設gene_id為AK009210。
點擊FASTA鍵，復制獲取序列。
2. Ensmbl：http://asia.ensembl.org/index.html
選擇物種類別，詳見Report-Sequence_Results-Supplementary（可選項）。紅框內輸入gene_id號，點擊GO。假設gene_id為ENSMUSG00000099021。
轉到Genbank，復制獲取序列。
3. RefSeq：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/
紅框內輸入gene_id號，點擊search。假設gene_id為C630043F03Rik。
點擊FASTA，獲取序列信息。
4. UCSC：http://genome.ucsc.edu/
Genomes下拉菜單選擇參考基因組，一般人類選擇hg19，鼠選擇mm10。
紅框內輸入gene_id號，點擊search。假設gene_id為Ivns1abp，點擊go。
點擊下圖的紅框。
點擊下圖的紅框。
選擇mRNA，復制獲取序列信息。
云序相關產品推薦：
m6A RNA全轉錄組甲基化測序
m5C RNA全轉錄組甲基化測序
m1A RNA全轉錄組甲基化測序
超微量RNA甲基化測序
比色法檢測整體甲基化水平
RIP
RNA Pull Down
Me-DIP測序
往期精彩回顧：
看表觀新修飾-6mA如何助力IF飆升!
10分以上m6A RNA甲基化測序文章----云序生物助力
不得了，大牛告訴你lncRNA甲基化如何研究
RNA甲基化進入超微量時代
小白必看！RNA甲基化整體水平鑒定的方法匯總
20分文章中的RNA甲基化，熱度與實力并存
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究匯總—非編碼RNA篇
云序生物最新“RNA 甲基化”研究匯總-擬南芥篇
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究匯總—病毒篇
Plant Cell：擬南芥發現全新m6A RNA去甲基化修飾酶
云序客戶12分頂級文章，教你如何巧用RIP測序玩轉分子機制！
2018年Nature雜志重磅級突破性研究成果--m5C RNA甲基化 云序生物
Nature突破性研究—RNA甲基化新修飾m1A 云序生物
Hepatology：m6A RNA甲基化酶METTL3促肝癌發展新玄機
上海云序生物科技有限公司
Shanghai Cloud-seq Biotech Co., Ltd.
地址：上海市松江區莘磚公路518號20號樓3樓
電話：021-64878766
傳真：021-64878766
網址：www.cloud-seq.com.cn
郵箱：market@cloud-seq.com.cn
Copyright(C) 1998-2025 生物器材網 電話：021-64166852;13621656896 E-mail：info@bio-equip.com