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斑馬魚的基因敲除定制(Cas9-KO)法介紹

瀏覽次數(shù):8883 發(fā)布日期:2019-8-5  來源:南京堯順禹生物科技有限公司
利用 CRISPR/Cas9 技術(shù),針對靶基因序列設(shè)計 sgRNA, 指導(dǎo) Cas9 蛋白在特定基因位點(diǎn)引起 DNA 雙鏈斷裂,在非同源性末端接合修復(fù)斷裂 DNA 的過程中,靶基因堿基突變或缺失被引入到斑馬魚基因組中,最終導(dǎo)致靶基因無法正常轉(zhuǎn)錄翻譯,達(dá)到基因敲除的目的。目前我們利用 CRISPR/Cas9 技術(shù),提供 TU 品系的基因敲除斑馬魚制備,TU 系是最為普遍使用的標(biāo)準(zhǔn)純遺傳背景品系之一。同時也可根據(jù)委托方的需求,提供 AB 以及其它遺傳背景的基因敲除斑馬魚服務(wù)。 
  • 班馬魚基因靶向改造敲除突變體的建立技術(shù)路線
    • 分析目標(biāo)基因的基因組結(jié)構(gòu),確定目標(biāo)基因靶向位置
    • 通過Sanger測序,確認(rèn)目標(biāo)基因靶向位置序列信息準(zhǔn)確
    • 根據(jù)每個目標(biāo)基因的靶向突變位置,設(shè)計并體外合成4條不同的sgRNA
    • 制備Cas9 mRNA或蛋白質(zhì)
    • 鑒定所制備的4條sgRNA是否具有在斑馬魚胚胎內(nèi)引導(dǎo)Cas9切割目標(biāo)基因的活性
    • 將有活性的sgRNA和Cas9 mRNA(或蛋白質(zhì))共同注射斑馬魚受精卵
    • 待注射胚胎生長至6 hpf后,隨機(jī)選取5枚胚胎,確認(rèn)Founder胚胎細(xì)胞攜帶目標(biāo)基因突變的等位基因
    • 將經(jīng)注射的受精卵飼養(yǎng)至45-60日齡時,通過對尾鰭的基因組鑒定確認(rèn)Founder(F0)體細(xì)胞攜帶目標(biāo)基因突變的等位基因
    • 獲得F0的后代F1代
    • 至45-60日齡時,通過剪尾鰭的方法進(jìn)行基因型鑒定,篩選F1個體,獲得基因敲除突變體
  • 乙方為甲方提供的最終服務(wù)產(chǎn)品
    • 提供可有效識別  基因的靶向突變位置基因組序列的sgRNA不少于1條
    • 提供攜帶   基因靶向突變的雜合子(當(dāng)純合突變不致死時,可能是兩個等位因均突變的純合突變子)斑馬魚(不小于1月齡) 3 尾(基因型可不相同)。
2.3上述突變體中,目標(biāo)基因的突變應(yīng)在外顯子所在區(qū)域,位于起始密碼子后,其突變類型為插入或缺失(Indel)突變,且應(yīng)是移碼突變,導(dǎo)致目標(biāo)基因編碼序列出現(xiàn)提前的終止密
碼子,預(yù)期編碼一個截短蛋白;或者,突變的位置由客戶指定,經(jīng)乙方認(rèn)定可行后,實(shí)施靶向改造,造成插入或缺失(Indel)突變。
2.4提供上述突變的目標(biāo)基因等位基因的基因型(附有測序報告);
2.5提供鑒定上述突變體的鑒定方法;
  • 提供階段性項(xiàng)目進(jìn)展報告
  • 提供上述基因靶向突變的斑馬魚突變體建立過程的技術(shù)服務(wù)項(xiàng)目總結(jié)報告。
發(fā)布者:南京堯順禹生物科技有限公司
聯(lián)系電話:025-58603268
E-mail:njfish365@163.com

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