盤古定量PCR在種質資源基因組學研究的應用
瀏覽次數:1346 發布日期:2024-4-17
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了解種質資源
種質資源,也稱為遺傳資源或基因資源,指的是那些對人類具有實際或潛在利用價值的遺傳材料。如農作物遺傳改良和品種改良的種子、種苗和組織等植物資源,品種優良的動物資源都屬于種質資源的范圍。
種質資源保護
我國幅員遼闊,種質資源極其豐富,位居世界首列。作物、畜禽、水產、農業微生物等農業種質資源是新品種選育的基礎,遺傳信息由上一代傳給下一代的載體,種質資源是人類生存不可或缺的重要資源之一。
因此,我國一直致力于采取多維度措施,保護和開發種質資源,實現農業現代化。
2024年1月1日,農業部一號文件 《關于學習運用“千村示范、萬村整治”工程經驗有力有效推進鄉村全面振興工作的實施意見》
文件提出“種業振興行動”,其內容包含如下:
1.強化種質資源保護利用,篩選挖掘大豆、玉米等優異種質和基因資源,推進育種創新攻關。
2.生物育種產業化提速,加快選育推廣高油高產大豆、短生育期油菜、耐鹽堿作物等生產急需的自主優良品種。
種質資源學和基因組學
生物種質資源的保護通常離不開現代科技基礎設施,包括種子庫、植物離體庫、DNA庫、微生物庫和動物種質資源庫,現代分子檢測方法可以為種質資源建立先進的植物基因組學和種子生物學實驗研究平臺。
定量PCR(Quantitative Polymerase Chain Reaction)在種質資源研究中有著廣泛的應用,定量PCR在這一領域的應用主要包括以下幾個方面:
1、基因型鑒定:定量PCR可以用于快速、準確地鑒定種質資源中的基因型。通過PCR反應檢測目標基因的存在與否以及其表達水平,可以幫助研究人員確定種質資源中所含有的有用基因型,為后續的遺傳改良工作提供重要信息。
2、基因表達分析:定量PCR可以定量檢測種質資源中特定基因的表達水平。通過比較不同種質資源或不同處理條件下目標基因的表達情況,可以揭示基因在生長發育過程中的調控機制,為選擇優良基因型提供依據。
3、遺傳改良:熒光實時定量PCR技術可以用于分子育種。通過分析動植物的基因組序列和遺傳特征,可以預測它們的生長、繁殖等性狀,幫助養殖者選擇優良的個體進行繁殖和培育
4、遺傳多樣性評估:定量PCR可以用于評估種質資源的遺傳多樣性。通過分析種質資源中多個基因座的遺傳變異情況,可以確定種質資源的遺傳背景和多樣性水平,為種質資源的保護和合理利用提供科學依據。
5、抗性鑒定:定量PCR可以用于檢測種質資源中對病蟲害等脅迫因子的抗性。通過PCR反應檢測與抗性相關的基因或標記物,可以篩選出具有抗性特點的種質資源,為抗性育種提供候選材料。
艾普拜為科研用戶開發了國際標準級qPCR系統——盤古快速定量PCR系統,遵循國際MIQE原則,性能出眾,非常適合種質資源研究。
•升溫速度可達8.5℃/s,一次快速完成96孔檢測并出具結果,產物得率高,特異性好
•溫控精度±0.1℃滿足敏感樣品對擴增溫度的嚴苛要求,保證陽性靶標的正常擴增
•支持12列溫度梯度功能,便于快速優化擴增所需條件
•光波導頂部檢測,無邊緣效應和光程差,無需校準
•6色檢測通道,支持各種常用熒光標記,兼容各種商業化qPCR試劑盒
•具備基因表達和基因分型強大的軟件功能,適合SNP/KASP等等位基因分型
總的來說,定量PCR在種質資源研究中的應用可以幫助研究人員更全面、深入地了解種質資源的遺傳特征、基因表達情況以及抗性等重要信息,為農作物遺傳改良和種質資源的合理利用提供技術支持。