隨著國家藥品監(jiān)督管理局批準了一批 AAV 制劑的臨床試驗申請,越來越多的 AAV 制劑進入大眾視野。AAV 制劑中病毒滴度的準確定量,是影響療效的關鍵因素。因此建立準確、穩(wěn)定的檢測流程對于細胞和基因治療企業(yè)來說尤為重要。數字 PCR 作為新一代的核酸定量工具,以其絕對定量與精準性高等特點,被細胞和基因治療行業(yè)快速接納并應用。
腺相關病毒(AAV)的介紹

腺相關病毒(Adeno-associated virus,AAV)是一類單鏈線狀 DNA 缺陷型病毒,需要輔助病毒(如腺病毒、單純皰疹病毒、痘苗病毒)存在時,才能進行復制。在基因治療的研究中,通常使用不需輔助病毒的重組 AAV 病毒(rAAV)將目的基因序列插入 rAAV 表達質粒中,包裝病毒,然后直接使用 rAAV 感染細胞就能完成目的基因的插入操作。rAAV 作為基因療法載體有以下優(yōu)勢:安全性高、免疫原性低;宿主細胞范圍廣;擴散能力強;體內表達基因時間長;適用種類多樣等。
腺相關病毒 AAV 的檢測
AAV 制劑的滴度檢測是生物企業(yè)中重要的環(huán)節(jié),穩(wěn)定及精確的檢測結果是臨床給藥的基礎保障。根據現有的檢測手段及原理,可以將其分為物理滴度及感染滴度兩大類型。物理滴度主要是指病毒顆粒滴度及基因組滴度,感染滴度主要指目的基因的轉導滴度。
物理滴度目前的主流方法是熒光定量法(qPCR),但 qPCR 往往由于其本身的技術原因,不同批次試劑中不同的標準曲線會影響其對最終濃度的計算,導致最終的滴度計算有所偏差。
達普生物提供一種更精準的檢測方案 —— 微滴式數字 PCR,可以直接量化 DNA 拷貝數。這種方法具有以下特點:
1. 絕對定量:無需標準曲線,直接定量目的序列,減少實驗復孔及標準曲線帶來的額外操作和實驗誤差。
2. 更加準確:與 qPCR 相比,數字 PCR 可以消除不同 PCR 反應擴增效率的不同引入的定量偏差。
3. 更加精確:實驗重復性好,實際樣品測試結果 CV<15%;且不受人為因素影響,在不同實驗人員操作的情況下,結果均顯示較小差異。
qPCR vs 數字 PCR
|
qPCR |
數字 PCR |
定量能力 |
依賴標準曲線,相對定量 |
絕對定量 |
精準度 |
好 |
極佳 |
重復性 |
好 |
極佳 |
抑制劑耐受情況 |
一般 |
較好 |
數據分析 |
人工劃定閾值 |
儀器自動分析 |
正是由于以上優(yōu)點,美國藥典章節(jié) “US Pharmacopeia Standards for Cell and Gene Therapy” 中,對 AAV 制劑的滴度測定推薦了數字 PCR 方法用于替代 qPCR 方法。
達普生物 AAV 病毒核酸滴度檢測套裝
為推動 AAV 病毒滴度更加精準定量,助力 AAV 制劑療法的深入研究。近日,達普生物基于星云數字 PCR 平臺,自主設計開發(fā)了 “腺相關病毒(AAV)滴度檢測試劑盒(數字PCR法)”。達普生物的星云數字 PCR 平臺搭配本試劑盒,為客戶提供從病毒制品準備到結果導出的完整解決方案,可應用于 AAV 生產制造中的質量控制。
達普生物-腺相關病毒(AAV)滴度檢測試劑盒優(yōu)勢:
- 操作簡便:無需標準曲線,試劑盒利用率高。
- 兼容性好:適合多種血清型檢測。
- 準確性好:具有較好的靈敏度、特異性,不受部分序列二級結構影響。
- 性價比高:數字 PCR 方法與 qPCR 方法實際耗材成本相似。
- 優(yōu)化流程:部分制品可使用免提取策略直接檢測培養(yǎng)物中的病毒滴度。
線性關系展示
實驗流程優(yōu)勢:數字 PCR vs qPCR

數字 PCR 實驗排布
數字 PCR 定量檢測無需標準曲線
● 低濃度重復性較好

qPCR 實驗排布
qPCR 定量檢測需要標準曲線
● 多批次,樣品少的檢測環(huán)境需要重復多次標準曲線
● 標準品需要稀釋,操作要求較高,重復性(尤其是低濃度)欠佳
達普生物數字 PCR 系統(tǒng)軟件合規(guī)性
為滿足企業(yè)客戶需求,達普生物數字 PCR 分析軟件 - Astrolabe 合規(guī)版軟件系統(tǒng)功能符合 FDA 21 CFR Part 11 法規(guī),經檢測保留的數據可作為檢驗后追溯的有效數據來源,確保生物醫(yī)藥企業(yè)生產、質控中數據記錄的合規(guī)性。
參考文獻:
1. Adeno-associated virus vector as a platform for gene therapy delivery;Nat Rev Drug Discov. 2019 May ; 18(5): 358–378. doi:10.1038/s41573-019-0012-9.
2. Absolute determination of single-stranded and self-complementary adeno-associated viral vector genome titers by droplet digital PCR;Hum Gene Ther Methods. 2014 Apr 1; 25(2): 115–125.Published online 2013 Dec 12. doi: 10.1089/hgtb.2013.131
3. https://en.wikipedia.org/wiki/
關于達普

達普生物科技有限公司孵化于香港科技大學,于 2018 年由多位海歸博士共同創(chuàng)立。在深圳、嘉興、香港三地設有研發(fā)中心,研發(fā)團隊近百人,建立了集微流控芯片、儀器及試劑生產為一體的 GMP 廠房。
公司專注于將液滴微流控技術應用于精準醫(yī)學領域,致力于成為集微流控芯片、儀器、試劑的研發(fā)和生產于一體的完整解決方案提供商。公司自主研發(fā)、生產三大技術平臺:高通量篩選系統(tǒng)、數字 PCR 系統(tǒng)和單細胞組學系統(tǒng),應用于高通量藥物質檢、抗體篩選、生物制品質檢、癌癥研究、癌癥早期篩查、靶向治療、無創(chuàng)產前診斷和病毒定量檢測等領域。
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達普生物科技有限公司致力于成為集微流控芯片、儀器、試劑、耗材研發(fā)生產一體的完整解決方案提供商。自主研發(fā)生產的兩大技術平臺:數字PCR和單細胞組學系統(tǒng)。產品適用于癌癥早期篩查、靶向治療、無創(chuàng)產前診斷、病毒定量檢測、高通量藥物和抗體篩選等領域。