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ChIP seq是指對染色質免疫共沉淀得到的基因進行高通量測序,最終實現將所研究的蛋白的DNA結合位點精確定位到參考基因組上。
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染色質免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)是研究蛋白質與DNA之間相互作用的重要技術手段。將ChIP與第二代測序技術相結合的ChIP-Seq技術,能夠高效地在全基因組范圍內檢測與組蛋白、轉錄因子等互作的DNA區段。
服務內容:
針對性項目方案設計+樣品檢測、ChIP文庫構建、測序+標準/個性化生物信息分析
常用策略:
Hiseq 2000,測序技術SE 1 × 36-50 ,數據量: ≥ 1 G 。( 數據量的選擇從理論上來說,決定于目的蛋白在全基因組上結合位點所占的比例。)
ChIP-Seq測序數據主要分析內容: