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服務商: 廣州賽哲生物科技有限公司 | 查看該公司所有服務 >> |
長鏈非編碼RNA(Long noncoding RNA,lncRNA)是一類轉錄長度大于200nt的RNA分子,屬于ncRNA(noncoding RNA,ncRNA)中片段較大的一些基因,它們本身缺乏明顯的開放閱讀框,不編碼蛋白,而是以RNA的形式在多種層面上調控基因的表達。近幾年來,ncRNA的研究越來越多,隨著一些ncRNA基因的克隆以及計算機生物信息學預測方法的發展,人們逐漸認識到ncRNA和蛋白質分子一樣參與了整個的生命活動。研究發現,已鑒定的ncRNA幾乎參與了生命活動的每個環節,包括基因轉錄調控、基因印跡與沉默、mRNA的穩定和翻譯、蛋白質的轉運和定位等。
目前預測的lncRNA多達數千個,但是科學家預計,哺乳動物基因組序列中大約4%~9%的序列產生的轉錄本是lncRNA,而只有1%的編碼蛋白序列。RNA高通量測序一次性產生上百萬RNA序列,能夠快速鑒定特定條件下表達的lncRNA。通過lncRNA高通量測序,能夠發現新的lncRNA。
為了深入研究lncRNA功能,賽哲生物推出基于Ion torrent高通量測序平臺的lncRNA-Seq服務,通過基于去除核糖體RNA的建庫方法以及高通量測序技術,可以得到細胞內所有RNA轉錄產物的序列,并通過后期的生物信息學分析,可對lncRNA進行深入的研究。
項目名稱 | 項目明細 | 周期(工作日) | 單位(元) |
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lncRNA測序 | lncRNA分離純化 | 20 | 25,000 |
文庫制備 | |||
模板制備 | |||
高通量測序 | |||
數據分析 |
方案制定
根據樣品信息和客戶要求,制定測序方案
樣本檢測
Agilent 2200
Nanodrop 2000
文庫制備
從總RNA中分離出mRNA,反轉成cDNA,構建文庫
或從總RNA中去除rRNA,反轉成cDNA,構建文庫
上機測序
Ion torrent上機測序
數據分析
基本數據分析
高級數據分析