隨著測(cè)序技術(shù)的發(fā)展，能夠更加容易的獲取基因組數(shù)據(jù)和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。然而，在海量數(shù)據(jù)中，您將需要的不僅僅是一面放大鏡去尋找研究問題的答案，更重要的是需要有一個(gè)實(shí)力生物信息學(xué)團(tuán)隊(duì)幫您排憂解難。菲沙基因?qū)嵙�科研團(tuán)隊(duì)可以幫助您挖掘數(shù)據(jù)中的豐富潛能。

 

成功案例
- 甜橙基因組序列分析分析其物種起源 (圖1, Nature Genetics1).
- 瘧疾寄生蟲的基因組對(duì)比發(fā)現(xiàn)關(guān)鍵酶可能與人類疾病有關(guān) (圖2, PLoS Computational Biology2).
- 100個(gè)肝癌組織的突變分析發(fā)現(xiàn)了獨(dú)特的突變特征 (Nature Genetics, under review).
- 利用全基因組測(cè)序挖掘出模式生物表型差異的遺傳基礎(chǔ) (Genetics3; BMC Genomics, in press).
- 松材線蟲腸道微生物的宏基因組分析揭示了松木樹脂降解過程中的關(guān)鍵共生關(guān)系 (Scientific Reports4).

 

菲沙優(yōu)勢(shì)
1. 際領(lǐng)先視野和影響力專家阮一駿，陳楠生，和Jeffrey Chu博士組成的頂尖的科學(xué)技術(shù)團(tuán)隊(duì)
2. 與專家面對(duì)面會(huì)談并協(xié)助項(xiàng)目方案設(shè)計(jì)
3. 算法、流程開發(fā)與個(gè)性化信息分析能力強(qiáng)
4. 快速解決問題和成果產(chǎn)出能力強(qiáng)

 

我們的服務(wù)
疾病研究                                                                                           農(nóng)作物和模式生物
癌癥驅(qū)動(dòng)基因分析                                                                            基因組重測(cè)序和新基因組組裝
遺傳病、罕見疾病致病基因以及機(jī)理檢測(cè)                                    全基因組和轉(zhuǎn)錄組研究
基因組SNV, CNV, 基因融合, 和復(fù)雜突變檢測(cè)                              表型和基因型的相關(guān)性分析
疾病獨(dú)特基因譜檢測(cè)                                                                        基因表達(dá)分析
…                                                                                                        物種進(jìn)化過程分析
                                                                                                            …

病原體                                                                                               宏基因組學(xué)
潛在的致病因素檢測(cè)                                                                        環(huán)境和組織微生物種類和豐度分析
基因家族變化分析                                                                            重要代謝通路構(gòu)建
病原體宿主相互作用                                                                        微生物meta特殊功能相關(guān)基因及機(jī)理分析
…   

                                                                                                    …

參考文獻(xiàn)
1. Xu, Q. et al. The draft genome of sweet orange (Citrus sinensis). Nature Genetics 45, 59-66 (2013).
2. Frech, C. & Chen, N. Genome comparison of human and non-human malaria parasites reveals species subset-specific genes potentially linked to human disease. PLoS Computational Biology 7, e1002320 (2011).
3. Chu, J.S. et al. Allelic ratios and the mutational landscape reveal biologically significant heterozygous SNVs. Genetics 190, 1225-33 (2012).
4. Cheng, X.Y. et al. Metagenomic analysis of the pinewood nematode microbiome reveals a symbiotic relationship critical for xenobiotics degradation. Scientific Reports 3, 1869 (2013).

 

個(gè)性化生物信息分析

生命世界充滿各種耐人尋味的奧秘，大量生物科學(xué)家著迷與此，致力于剖析生命現(xiàn)象的本質(zhì)，而高通量測(cè)序技術(shù)成為了生物研究領(lǐng)域的新星。相比后續(xù)生物信息分析而言，測(cè)序數(shù)據(jù)的產(chǎn)出變得越來越容易。鑒于研究目的和研究對(duì)象的不同，單一套路式的信息分析流程已經(jīng)無法滿足科研人員的需求。

菲沙基因擁有多名海內(nèi)外知名的生物信息專家，以及大量經(jīng)驗(yàn)豐富的生物信息分析工程師，可以從合作伙伴的研究熱點(diǎn)、材料特殊性、關(guān)注的生物學(xué)核心問題出發(fā)，為您提供定制化的生物信息分析服務(wù)。

 

軟件和算法開發(fā)

菲沙基因擁有一批高水平的生物信息研發(fā)團(tuán)隊(duì)，團(tuán)隊(duì)核心成員均擁有生物學(xué)和計(jì)算機(jī)科學(xué)雙學(xué)位，具有極強(qiáng)的專業(yè)素養(yǎng)和軟件開發(fā)能力，具有生物軟件自主開發(fā)的能力。目前公司已經(jīng)開發(fā)了如下生物信息軟件：

        基因建模軟件genBlast系列，包括genBlastA和genBlastG
        用于尋找并分析基因組共線性的生物信息學(xué)軟件OrthoCluster以及OrthoClusterDB
        用于比對(duì)基因和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的生物信息學(xué)軟件FeatureStack
        分析遺傳多樣性對(duì)基因突變作用的生物信息學(xué)軟件CooVar
        第三代DNA測(cè)序方法的生物信息學(xué)軟件VariationBlast
      
菲沙基因提供專業(yè)的生物信息軟件的開發(fā)和使用服務(wù)，并可以幫助客戶開發(fā)指定功能的生物信息學(xué)軟件。
 

生物數(shù)據(jù)庫的開發(fā)和維護(hù)

菲沙基因核心技術(shù)團(tuán)隊(duì)人員參與構(gòu)建了大型生物信息學(xué)平臺(tái) WormBase，擁有大型生物數(shù)據(jù)庫開發(fā)的經(jīng)驗(yàn)，可以幫助科研人員構(gòu)建特定物種的生物數(shù)據(jù)庫。
 

高質(zhì)量論文修改  

三代測(cè)序數(shù)據(jù)信息分析  

生物信息培訓(xùn)

武漢菲沙基因信息有限公司位于武漢國(guó)家生物產(chǎn)業(yè)基地——光谷生物城，是一家集三維基因組學(xué)技術(shù)服務(wù)、第二代和第三代基因測(cè)序、生物信息軟件開發(fā)、生物信息分析、基因組數(shù)據(jù)庫搭建、分子標(biāo)記開發(fā)、基因檢測(cè)技術(shù)研發(fā)等生物信息上下游產(chǎn)業(yè)于一體的高新技術(shù)企業(yè)。菲沙基因聯(lián)合國(guó)內(nèi)外著名高校和科研機(jī)構(gòu)，擁有一批國(guó)際知名的基因組學(xué)和生物信息學(xué)專家，致力于提供全球領(lǐng)先的生物信息技術(shù)服務(wù)。
依托國(guó)際先進(jìn)的第二代和第三代高通量測(cè)序平臺(tái)，以及20萬億次的高性能計(jì)算平臺(tái)，菲沙基因可以針對(duì)人類健康、疾病防治、環(huán)境保護(hù)、動(dòng)植物研究、微生物應(yīng)用等不同領(lǐng)域的基因組學(xué)問題展開研究，能夠?yàn)椴煌�需求的合作伙伴提供包括�?shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、樣品選取、測(cè)序策略，以及后續(xù)定制化信息分析在內(nèi)的一站式、個(gè)性化整體解決方案。
隨著科學(xué)技術(shù)的發(fā)展，即將到來的基因組學(xué)第三次浪潮——三維基因組研究，已經(jīng)成為全球生物學(xué)界的科研焦點(diǎn)。菲沙基因在提供3C、4C、5C、Hi-C等三維基因組構(gòu)象技術(shù)服務(wù)的基礎(chǔ)上，在國(guó)內(nèi)率先引進(jìn)最新的染色質(zhì)遠(yuǎn)程交互測(cè)序技術(shù)（ChIA-PET），為進(jìn)一步研究基因組三維空間結(jié)構(gòu)與功能提供了完整解決方案，能夠協(xié)助合作伙伴在下一輪基因組研究浪潮中搶占學(xué)科發(fā)展的有利先機(jī)。
憑借全球領(lǐng)先的生物信息分析能力，菲沙基因已經(jīng)以多種形式先后與國(guó)內(nèi)外著名高校和科研機(jī)構(gòu)展開了深度合作，合作伙伴包括杰克森實(shí)驗(yàn)室、西蒙菲沙大學(xué)、中國(guó)科學(xué)院、中國(guó)農(nóng)科院、清華大學(xué)、上海交通大學(xué)、復(fù)旦大學(xué)、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)、第二軍醫(yī)大學(xué)、同濟(jì)醫(yī)院、上海東方肝膽外科醫(yī)院等。
“以生物信息學(xué)助推生命科學(xué)的研究，以基因組醫(yī)學(xué)促進(jìn)人類健康的發(fā)展”是菲沙基因的使命；“成為生物信息學(xué)領(lǐng)域的引領(lǐng)者”是菲沙基因的愿景。我們期望與各領(lǐng)域的專家合作，制定最優(yōu)的解決方案，提供快速、準(zhǔn)確、專業(yè)的服務(wù)，共同迎接生命科學(xué)研究中的挑戰(zhàn)。