熒光差異雙向凝膠電泳(DIGE)是一種在2D電泳之前標(biāo)記蛋白質(zhì)樣品的方法,可以對樣品間蛋白質(zhì)豐度進行精確分析。
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產(chǎn)品定義
熒光差異雙向凝膠電泳(DIGE)是一種在2D電泳之前標(biāo)記蛋白質(zhì)樣品的方法,可以對樣品間蛋白質(zhì)豐度進行精確分析。
技術(shù)原理
Ettan DIGE熒光差異蛋白質(zhì)表達(dá)分析系統(tǒng)在傳統(tǒng)雙向凝膠電泳技術(shù)的基礎(chǔ)上,結(jié)合多重?zé)晒夥治龅姆椒ǎ谕粔K膠上共同分離多個分別由不同熒光標(biāo)記(Cy2,Cy3,Cy5)的樣品,并且第一次引入內(nèi)標(biāo)的概念,極大地提高結(jié)果的準(zhǔn)確性、可靠性和重復(fù)性。在DIGE實驗中,每個蛋白質(zhì)點都有它自己的內(nèi)標(biāo),并且軟件全自動根據(jù)每個蛋白質(zhì)點的內(nèi)標(biāo)對其表達(dá)量進行校準(zhǔn),保證所檢測到的蛋白質(zhì)豐度變化是真實的。
Ⅰ 熒光染料采用分子量和等電點相互匹配的三種熒光標(biāo)記分子Cy2、Cy3、Cy5,其特殊設(shè)計的NHS脂活性基團通過氨基酸橋連接作用于蛋白質(zhì)的賴氨酸上,使檢測靈敏度達(dá)到125pg。
Ⅱ Cy2標(biāo)記所有樣品的等量混合樣作為內(nèi)標(biāo),理論上包含了需要分析樣品的所有蛋白質(zhì)點,存在于每一塊需要被分析的膠中。采用專業(yè)軟件對蛋白質(zhì)點作出更加可觀的定量變化分析。
實驗流程
注釋:“樣品及實驗預(yù)判”包括蛋白質(zhì)定量、至少一次
雙向凝膠電泳實驗,對樣品質(zhì)量判斷及實驗條件優(yōu)化。
技術(shù)優(yōu)勢
相對應(yīng)傳統(tǒng)的雙向電泳技術(shù),檢測靈敏度更高,大大節(jié)約樣品;
采用內(nèi)標(biāo)對數(shù)據(jù)進行歸一化處理,消除膠與膠之間差異造成的誤差,準(zhǔn)確度高。
應(yīng)用領(lǐng)域
疾病標(biāo)志物篩選 作用機制研究
植物抗逆研究 藥物作用靶點研究
特殊功能蛋白質(zhì)篩選
樣品需求
樣品類型 |
樣品要求(/組樣品) |
蛋白質(zhì)提取物 |
濃度 > 4μg/μl,蛋白子總量 > 5mg |
細(xì)胞樣品 |
細(xì)胞量 > 108 |
組織樣品 |
濕重 > 300mg |
體液樣品 |
血液體積 > 1ml |
技術(shù)參考案例
[1] Samuel MA, Tang W, et al. Proteomic analysis of Brassica stigmatic proteins following the self-incompatibility reaction reveals a role for microtubule dynamics during pollen responses. Mol Cell Proteomics. 2011; 10(12).
[2] De la Cuesta F, Alvarez-Llamas, et al. A proteomic focus on the alterations occurring at the human atherosclerotic coronary intima. Mol Cell Proteomics. 2011; 10(4).
[3] Hong Y, Peng J, et al. Proteomic analysis of Schistosoma japonicum Schistosomulum proteins that are differentially expressed among hosts differing in their susceptibility to the infection. Mol Cell Proteomics. 2011; 10(8).