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上海百趣代謝組學(xué)技術(shù)研究中心劉志鵬高級(jí)研究員與中山大學(xué)孫逸仙紀(jì)念醫(yī)院任萌主任內(nèi)分泌課題組合作
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發(fā)表時(shí)間:2022年1月
發(fā)表期刊:Frontiers in Endocrinology
影響因子:5.555
研究背景
上海百趣代謝組學(xué)技術(shù)研究中心劉志鵬高級(jí)研究員與中山大學(xué)孫逸仙紀(jì)念醫(yī)院任萌主任內(nèi)分泌課題組合作,選取縱向研究隊(duì)列中糖尿病前期人群跟蹤5年前后313個(gè)志愿者的血清樣本(其中跟蹤5年后發(fā)展為Ⅱ型糖尿病的153人,5年后仍為糖尿病前期的160人),基于LC-MS非靶向代謝組學(xué)技術(shù)平臺(tái)和生物信息學(xué)技術(shù),完成了中國糖尿病前期人群發(fā)展成Ⅱ型糖尿病的潛在生物代謝標(biāo)記物研究[1](圖1A)。
結(jié)果
臨床數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
如表1所示,對(duì)已有的檢測收錄的臨床指標(biāo)統(tǒng)計(jì)分析發(fā)現(xiàn),兩基線組中除Glu120、HbA1c和尿白蛋白有顯著差異外,其他指標(biāo)無明顯變化;跟蹤5年前后的臨床數(shù)據(jù)結(jié)果表明,發(fā)展為Ⅱ型糖尿病組的Glu0、Glu120、BMI、WC、waist-hip ratio和HbA1c相較于對(duì)應(yīng)的基線樣本顯著升高;此外,Ⅱ型糖尿病風(fēng)險(xiǎn)因素中,LDL-C、 TC和尿白蛋白在兩組間也有顯著差異,雖然GGT也顯著差異,但在兩組中的含量均在正常范圍。
表1. 兩基線組臨床指標(biāo)統(tǒng)計(jì)結(jié)果
代謝物輪廓譜分析
對(duì)發(fā)展為糖尿病的153個(gè)志愿者5年前后的血清樣本進(jìn)行非靶代謝組學(xué)分析,PERMANOVA分析和多變量統(tǒng)計(jì)分析發(fā)現(xiàn)兩組間代謝物存在顯著差異(Q-value < 0.05);對(duì)代謝物輪廓譜和臨床數(shù)據(jù)的PERMANOVA分析發(fā)現(xiàn),LDL-C和TC與代謝物有一定關(guān)聯(lián)(P-value < 0.05, Q-value > 0.05),年齡和Glu0在女性中與血清代謝輪廓譜弱相關(guān),吸煙行為與男性血清代謝物輪廓譜弱相關(guān)。結(jié)合單變量統(tǒng)計(jì)分析同時(shí)校正兩組間顯著相關(guān)的臨床指標(biāo)(Age、BMI、WC、waist-hip ratio、urine albumin、HDL-C、LDL-C、TC、GGT、Glu0、Glu120、HbA1C)后,發(fā)現(xiàn)了101個(gè)可能與糖尿病發(fā)展顯著相關(guān)的差異代謝物(圖1B);進(jìn)一步的代謝通路拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)MetPA分析發(fā)現(xiàn)(圖1C),氨基酸代謝和脂質(zhì)代謝相關(guān)的代謝通路與糖尿病發(fā)展密切相關(guān)。那么哪些代謝物和臨床指標(biāo)是與Ⅱ型糖尿病發(fā)生相關(guān)的潛在風(fēng)險(xiǎn)因素呢?通過多元邏輯回歸校正上述差異顯著臨床指標(biāo),分析發(fā)現(xiàn)有20個(gè)與Ⅱ型糖尿病發(fā)生顯著正相關(guān)的獨(dú)立風(fēng)險(xiǎn)因素,如inosine、carvacrol、Glu0和Glu120(圖1D)。
圖1. 研究思路和差異代謝物分析結(jié)果
隨機(jī)森林模型篩選潛在生物標(biāo)志物
為研究發(fā)現(xiàn)糖尿病前期人群發(fā)展成Ⅱ型糖尿病的潛在生物代謝標(biāo)記物,從發(fā)展成糖尿病的5年前后153個(gè)人群按照3:2比例進(jìn)行隨機(jī)篩選,構(gòu)建成訓(xùn)練集(91糖尿病前期患者+91糖尿病患者)和測試集(62個(gè)糖尿病前期患者+62糖尿病患者),首先用隨機(jī)森林模型從兩組間差異顯著的臨床指標(biāo)中(不考慮Glu0、Glu120、HbA1C和年齡)篩選得到3個(gè)重要指標(biāo)(BMI、waist-hip ratio和WC,圖2A&D),以得到的3個(gè)臨床指標(biāo)建模,隨機(jī)森林模型在驗(yàn)證集中的AUC為55.79%(95%CI: 49.38-62.19%,圖2B),同時(shí)選取跟蹤5年后仍為糖尿病前期的160個(gè)基線樣本進(jìn)行預(yù)測,發(fā)現(xiàn)臨床指標(biāo)的預(yù)測效果不理想(圖2C);同時(shí)也加入了臨床上的5個(gè)傳統(tǒng)臨床指標(biāo)(DBP、SBP、TG、LDL和TyG(=LN〔fasting TG(mg/dl)*Glu0(mg/dl)/2〕))建立模型,隨機(jī)森林模型的AUC=71.87% (95% CI: 62.79%-80.94%)有所提高(圖2E&F)。隨后 ,隨機(jī)森林模型從101個(gè)差異代謝物中篩選得到13個(gè)重要代謝物(圖2G&J,如Insine(-)、Carvacrol(-)、PC(P-17:0/0:0(+))等),預(yù)測模型的AUC達(dá)到95.68% (95% CI: 92.61-98.75%)(圖2H),能較好的預(yù)測新的樣本(圖2I)。最后將3個(gè)臨床指標(biāo)和11個(gè)代謝物合并建模,模型的預(yù)測效果AUC=98.10% (95% CI: 96.29-99.91%)稍有提高(圖2K&L)。
圖2.臨床指標(biāo)和代謝物隨機(jī)森林模型
結(jié)論
本文通過非靶代謝組技術(shù)和生物信息技術(shù),對(duì)中國糖尿病前期隊(duì)列樣本進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)了13個(gè)在Ⅱ型糖尿病發(fā)生發(fā)展過程中有重要作用的代謝物,同時(shí)也能大大提高Ⅱ型糖尿病的診斷能力。總之,這些結(jié)果表明在糖尿病前期到糖尿病的發(fā)展過程中,血清代謝譜出現(xiàn)了復(fù)雜性的變化。
參考文獻(xiàn):
文獻(xiàn)原文下載鏈接:
https://pan.baidu.com/s/1uT3iXuFNOeuyEUMgwLzorA
提取碼: jgmw
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