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中國糖尿病前期人群發(fā)展成Ⅱ型糖尿病的潛在生物代謝標(biāo)記物研究
上海百趣代謝組學(xué)技術(shù)研究中心劉志鵬高級(jí)研究員與中山大學(xué)孫逸仙紀(jì)念醫(yī)院任萌主任內(nèi)分泌課題組合作
服務(wù)類別:測序/合成總訪問:219
最后更新:2022-3-24半年訪問:12
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文章標(biāo)題:Potential Novel Serum Metabolic Markers Associated With Progression of Prediabetes to Overt Diabetes in a Chinese Population

發(fā)表時(shí)間:2022年1月

發(fā)表期刊:Frontiers in Endocrinology

影響因子:5.555
 

研究背景

上海百趣代謝組學(xué)技術(shù)研究中心劉志鵬高級(jí)研究員與中山大學(xué)孫逸仙紀(jì)念醫(yī)院任萌主任內(nèi)分泌課題組合作,選取縱向研究隊(duì)列中糖尿病前期人群跟蹤5年前后313個(gè)志愿者的血清樣本(其中跟蹤5年后發(fā)展為Ⅱ型糖尿病的153人,5年后仍為糖尿病前期的160人),基于LC-MS非靶向代謝組學(xué)技術(shù)平臺(tái)和生物信息學(xué)技術(shù),完成了中國糖尿病前期人群發(fā)展成Ⅱ型糖尿病的潛在生物代謝標(biāo)記物研究[1](圖1A)。
 

結(jié)果


臨床數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
如表1所示,對(duì)已有的檢測收錄的臨床指標(biāo)統(tǒng)計(jì)分析發(fā)現(xiàn),兩基線組中除Glu120、HbA1c和尿白蛋白有顯著差異外,其他指標(biāo)無明顯變化;跟蹤5年前后的臨床數(shù)據(jù)結(jié)果表明,發(fā)展為Ⅱ型糖尿病組的Glu0、Glu120、BMI、WC、waist-hip ratio和HbA1c相較于對(duì)應(yīng)的基線樣本顯著升高;此外,Ⅱ型糖尿病風(fēng)險(xiǎn)因素中,LDL-C、 TC和尿白蛋白在兩組間也有顯著差異,雖然GGT也顯著差異,但在兩組中的含量均在正常范圍。

表1. 兩基線組臨床指標(biāo)統(tǒng)計(jì)結(jié)果



代謝物輪廓譜分析
 

對(duì)發(fā)展為糖尿病的153個(gè)志愿者5年前后的血清樣本進(jìn)行非靶代謝組學(xué)分析,PERMANOVA分析和多變量統(tǒng)計(jì)分析發(fā)現(xiàn)兩組間代謝物存在顯著差異(Q-value < 0.05);對(duì)代謝物輪廓譜和臨床數(shù)據(jù)的PERMANOVA分析發(fā)現(xiàn),LDL-C和TC與代謝物有一定關(guān)聯(lián)(P-value < 0.05, Q-value > 0.05),年齡和Glu0在女性中與血清代謝輪廓譜弱相關(guān),吸煙行為與男性血清代謝物輪廓譜弱相關(guān)。結(jié)合單變量統(tǒng)計(jì)分析同時(shí)校正兩組間顯著相關(guān)的臨床指標(biāo)(Age、BMI、WC、waist-hip ratio、urine albumin、HDL-C、LDL-C、TC、GGT、Glu0、Glu120、HbA1C)后,發(fā)現(xiàn)了101個(gè)可能與糖尿病發(fā)展顯著相關(guān)的差異代謝物(圖1B);進(jìn)一步的代謝通路拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)MetPA分析發(fā)現(xiàn)(圖1C),氨基酸代謝和脂質(zhì)代謝相關(guān)的代謝通路與糖尿病發(fā)展密切相關(guān)。那么哪些代謝物和臨床指標(biāo)是與Ⅱ型糖尿病發(fā)生相關(guān)的潛在風(fēng)險(xiǎn)因素呢?通過多元邏輯回歸校正上述差異顯著臨床指標(biāo),分析發(fā)現(xiàn)有20個(gè)與Ⅱ型糖尿病發(fā)生顯著正相關(guān)的獨(dú)立風(fēng)險(xiǎn)因素,如inosine、carvacrol、Glu0和Glu120(圖1D)。

圖1. 研究思路和差異代謝物分析結(jié)果

隨機(jī)森林模型篩選潛在生物標(biāo)志物
為研究發(fā)現(xiàn)糖尿病前期人群發(fā)展成Ⅱ型糖尿病的潛在生物代謝標(biāo)記物,從發(fā)展成糖尿病的5年前后153個(gè)人群按照3:2比例進(jìn)行隨機(jī)篩選,構(gòu)建成訓(xùn)練集(91糖尿病前期患者+91糖尿病患者)和測試集(62個(gè)糖尿病前期患者+62糖尿病患者),首先用隨機(jī)森林模型從兩組間差異顯著的臨床指標(biāo)中(不考慮Glu0、Glu120、HbA1C和年齡)篩選得到3個(gè)重要指標(biāo)(BMI、waist-hip ratio和WC,圖2A&D),以得到的3個(gè)臨床指標(biāo)建模,隨機(jī)森林模型在驗(yàn)證集中的AUC為55.79%(95%CI: 49.38-62.19%,圖2B),同時(shí)選取跟蹤5年后仍為糖尿病前期的160個(gè)基線樣本進(jìn)行預(yù)測,發(fā)現(xiàn)臨床指標(biāo)的預(yù)測效果不理想(圖2C);同時(shí)也加入了臨床上的5個(gè)傳統(tǒng)臨床指標(biāo)(DBP、SBP、TG、LDL和TyG(=LN〔fasting TG(mg/dl)*Glu0(mg/dl)/2〕))建立模型,隨機(jī)森林模型的AUC=71.87% (95% CI: 62.79%-80.94%)有所提高(圖2E&F)。隨后 ,隨機(jī)森林模型從101個(gè)差異代謝物中篩選得到13個(gè)重要代謝物(圖2G&J,如Insine(-)、Carvacrol(-)、PC(P-17:0/0:0(+))等),預(yù)測模型的AUC達(dá)到95.68% (95% CI: 92.61-98.75%)(圖2H),能較好的預(yù)測新的樣本(圖2I)。最后將3個(gè)臨床指標(biāo)和11個(gè)代謝物合并建模,模型的預(yù)測效果AUC=98.10% (95% CI: 96.29-99.91%)稍有提高(圖2K&L)。

圖2.臨床指標(biāo)和代謝物隨機(jī)森林模型

 

結(jié)論


本文通過非靶代謝組技術(shù)和生物信息技術(shù),對(duì)中國糖尿病前期隊(duì)列樣本進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)了13個(gè)在Ⅱ型糖尿病發(fā)生發(fā)展過程中有重要作用的代謝物,同時(shí)也能大大提高Ⅱ型糖尿病的診斷能力。總之,這些結(jié)果表明在糖尿病前期到糖尿病的發(fā)展過程中,血清代謝譜出現(xiàn)了復(fù)雜性的變化。
 

參考文獻(xiàn):

1. Ren M, Lin Dz, Liu ZP, Sun K, Wang C, Lao Gj, Fan Yq, Wang Xy, Liu J, Du J, Zhu Gb, Wang Jh and Yan L. Potential Novel Serum Metabolic Markers Associated With Progression of Prediabetes to Overt Diabetes in a Chinese Population. Front. Endocrinol, 2022; 12:745214.

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