定量蛋白質(zhì)組學(Quantitative Proteomics)是對一個基因組表達的全部蛋白質(zhì)或一個復雜混合體系內(nèi)所有蛋白質(zhì)進行精確鑒定和定量。可用于篩選和尋找任何因素引起的樣本之間的差異表達蛋白,結(jié)合生物信息學揭示細胞生理病理功能,同時也可對某些關(guān)鍵蛋白進行定性和定量分析。
iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)技術(shù)是由AB SCIEX公司研發(fā)的一種體外同重同位素標記的相對與絕對定量技術(shù)。蛋白定量iTRAQ技術(shù)利用多種同位素試劑標記蛋白多肽N末端或賴氨酸側(cè)鏈基團,經(jīng)高精度質(zhì)譜儀串聯(lián)分析,可同時比較多達8種樣品之間的蛋白組表達量差異,是近年來定量蛋白質(zhì)組學常用的高通量篩選技術(shù)。
IBT(Isobaric Tags)蛋白定量分析,作為常規(guī)iTRAQ蛋白定量分析的升級版,是華大基因首推的蛋白定量領(lǐng)域新產(chǎn)品。它基于華大基因與合作伙伴共同開發(fā)的IBT標記技術(shù),通過深入優(yōu)化實驗步驟和信息分析流程,將原本iTRAQ技術(shù)的標記上限8個樣本/批次,增加至16個樣本/批次甚至更多,結(jié)合高分辨率質(zhì)譜儀高效快速的掃描效率,全面解決多于8個比較組的蛋白樣本定量問題。IBT蛋白定量分析產(chǎn)品能夠提供優(yōu)于常規(guī)iTRAQ技術(shù)的鑒定、定量結(jié)果,為廣大客戶提供一種性價比更高的蛋白組定量分析新選擇。
TMT(Tandem Mass Tag)串聯(lián)質(zhì)譜標記技術(shù)是由Thermo公司研發(fā)的一種體外同重同位素標記的相對與絕對定量技術(shù)。蛋白定量TMT技術(shù)利用多種同位素試劑標記蛋白多肽N末端或賴氨酸側(cè)鏈基團,包括4plex、8plex、16plex等不同數(shù)量標簽的產(chǎn)品,經(jīng)高精度質(zhì)譜儀串聯(lián)分析,最新推出的TMTpro 18plex可同時比較多達18個樣品之間的蛋白組表達量差異,是近年來定量蛋白質(zhì)組學常用的高通量篩選技術(shù)。

圖1 TMT試劑結(jié)構(gòu)
產(chǎn)品優(yōu)勢
- 通量高:可同時對2-18種以內(nèi)實驗樣本進行蛋白組定量分析和比較;
- 周期短:標記混合上樣大幅度壓縮機時,縮短項目周期;
- 重復性高:采用多個標記樣本同時上機的方法,避免樣本分別上機檢測和傳統(tǒng)制膠實驗重復性差的問題;
- 經(jīng)驗豐富:10余年豐富項目經(jīng)驗,40+項質(zhì)控保障,200+篇質(zhì)譜文章發(fā)表;
- 云平臺交付:采用Dr. Tom云平臺進行數(shù)據(jù)交付,便于開展零生信基礎的數(shù)據(jù)挖掘,以及同轉(zhuǎn)錄組的自主關(guān)聯(lián)分析;
- 一站式、多組學服務:提供經(jīng)典的蛋白質(zhì)組非靶向發(fā)現(xiàn)+靶向驗證一站式服務;以及蛋白質(zhì)組+轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組+代謝組、常規(guī)蛋白質(zhì)組+磷酸化蛋白質(zhì)組學等一系列多組學關(guān)聯(lián)分析服務。
產(chǎn)品應用
疾病生物標志物篩選和驗證
疾病發(fā)生發(fā)展過程中的蛋白表達調(diào)控機制
藥效評估
重要農(nóng)作物農(nóng)藝性及其改良措施
動植物生長發(fā)育機制研究
抗逆抗病機制研究
致病機理研究
耐藥性研究
宿主-微生物的相互作用機制研究
技術(shù)路線

信息分析
信息分析條款
|
信息分析條款
|
標準信息分析
|
1 標準信息分析內(nèi)容
1.1 數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計
1.2 蛋白質(zhì)鑒定結(jié)果
1.3 蛋白質(zhì)定量結(jié)果
1.4 蛋白質(zhì)GO分析
1.5 蛋白質(zhì)KOG/COG/eggNOG分析
1.6 蛋白質(zhì)Pathway代謝通路分析
1.7 差異蛋白的GO富集分析
1.8 差異蛋白的Pathway富集分析
1.9 差異蛋白KOG/COG/eggNOG富集分析
1.10 重復性分析(僅針對設計了重復的實驗)
1.11多樣品間表達模式聚類(三個或三個以上樣品可提供)
1.12 差異表達蛋白互作分析
1.13 差異表達蛋白亞細胞定位
|
bio-equip.com
華大科技于2012年完成整合,致力于成為全球生命科學研究機構(gòu)的首選科技服務商,為從事生命科學研究的機構(gòu)和企業(yè)提供高質(zhì)量、行業(yè)領(lǐng)先的基因測序、質(zhì)譜、合成生物學、生物數(shù)據(jù)庫、云計算等標準化的技術(shù)服務和綜合的全流程解決方案。 目前,公司服務已經(jīng)覆蓋了全球100多個國家和地區(qū),擁有7,000多位合作單位,為25,000多位行業(yè)聯(lián)系人提供了杰出技術(shù)支撐與服務,更通過深度合作完成了一系列大型基因組科研計劃和國際多邊合作項目。科研積累上,截至2020年9月底,公司累計參與發(fā)表近1,500篇文章,其中CNNS 120+。截止2022年3月,華大自主測序平臺DNBSEQTM 助力發(fā)表2,013+篇高質(zhì)量文章,影響因子合計8,800+,并實現(xiàn)CNS三大主刊發(fā)文。