端粒長度檢測在衰老疾病和tumour中也具有重要診斷價(jià)值。其主要機(jī)制在于端粒是細(xì)胞衰老的分子鐘,由于DNA 聚合酶不能完整的復(fù)制染色體的末端(DNA 復(fù)制問題),細(xì)胞每分裂一次,端粒就變短一點(diǎn)。幾乎所有的正常人體細(xì)胞會(huì)隨著細(xì)胞分裂出現(xiàn)端粒逐漸縮短,并最終引發(fā)細(xì)胞復(fù)制性衰老。此時(shí),極少數(shù)細(xì)胞獲得了端粒酶活性,并且繼續(xù)分裂轉(zhuǎn)化為tumour細(xì)胞。
就目前而言,最常用的端粒長度檢測方法包括:端粒末端限制性片段分析(Terminalrestriction fragment,TRF),定量PCR(qPCR),熒光原位雜交(Fluorescencein situ hybridization,F(xiàn)ISH),單鏈端粒長度分析(Singletelomere length analysis,STELA)和基于全基因組測序(WGS)的端粒長度分析。
基礎(chǔ)研究通常檢測培養(yǎng)的細(xì)胞或組織端粒長度,臨床研究和流行病學(xué)研究通常檢測外周血淋巴細(xì)胞的端粒長度。如果有大規(guī)模的樣本需要進(jìn)行高通量檢測,例如流行病研究及臨床大樣本的端粒長度篩查,qPCR 是比較好的選擇,qPCR 用于流行病學(xué)研究有簡便、經(jīng)濟(jì)、高通量,DNA 用量少等優(yōu)勢。世界上最大規(guī)模的(10萬人)端粒長度檢測項(xiàng)目(Lapham et al., 2015),采用的即是qPCR方法。
檢測原理
該項(xiàng)服務(wù)基于自主研發(fā)的雙色熒光定量法端粒長度檢測試劑盒,應(yīng)用雙色熒光QPCR,適用于血液、口腔拭子或細(xì)胞DNA。采用新型多拷貝基因作為內(nèi)參基因,開創(chuàng)了擴(kuò)增效率高、穩(wěn)定性強(qiáng)、誤差更小的雙色熒光qPCR法,并初步建立了面向中國人群、包含1500例階梯式年齡組血樣DNA端粒長度數(shù)據(jù)庫。
服務(wù)流程
1.樣本DNA提取;
2.DNA質(zhì)控;
3.qPCR擴(kuò)增。
提供結(jié)果
根據(jù)定量PCR結(jié)果,計(jì)算出的T/S比值。
樣本要求
1、若樣品為血液基因組DNA,要求:DNA濃度≥20ng/ul,體積>20ul。純度OD260/OD280 在1.8~2.0之間。
2、若分型樣品為血樣,樣本要求:血液樣品,體積大于500ul,只能采用EDTA抗凝劑抗凝,送樣過程中請注意保持低溫,防止DNA降解。提取DNA將收取DNA提取費(fèi)。
3、若為唾液樣本,需保存于專用管中。
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