轉(zhuǎn)錄組（Transcriptome）是指一個(gè)活細(xì)胞所能轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和，是研究細(xì)胞表型和功能的一個(gè)重要手段。轉(zhuǎn)錄組學(xué)（Transcriptomics）是使用高通量測序技術(shù)，全面快速獲取某一物種特定組織或器官在某一狀態(tài)下RNA序列信息，并對其結(jié)構(gòu)和表達(dá)信息進(jìn)行分析。可用于預(yù)測基因結(jié)構(gòu)、可變剪切和其他轉(zhuǎn)錄修飾，并可定量測定每個(gè)轉(zhuǎn)錄本在生長過程中和不同條件下表達(dá)水平的變化。

（Schematics of RNA-Seq workflow. Wang Y et al., Bioinformatics. 2011）

麥特繪譜可提供的技術(shù)服務(wù)：

1）真核有參轉(zhuǎn)錄組測序

真核生物轉(zhuǎn)錄組測序可以分為有參和無參的情況。真核有參轉(zhuǎn)錄組測序，指對已有參考基因組的真核生物或其組織、細(xì)胞等進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序。通過與參考基因組比對，可驗(yàn)證轉(zhuǎn)錄組測序的測序飽和度和基因覆蓋度，同時(shí)可獲得基因結(jié)構(gòu)、基因表達(dá)差異，和可變剪接等信息。

2）真核無參轉(zhuǎn)錄組測序

真核生物轉(zhuǎn)錄組測序可以分為有參和無參的情況。真核無參轉(zhuǎn)錄組測序，指在無參考基因組的情況下,對真核生物轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行測序。真核無參轉(zhuǎn)錄組測序在獲得原始數(shù)據(jù)后,首先要進(jìn)行質(zhì)控拼接為unigene，再以unigene為參考序列進(jìn)行后續(xù)分析,包括功能注釋、SNP、SSR標(biāo)記開發(fā)等。也可以對多個(gè)樣本進(jìn)行差異基因表達(dá)分析和差異基因功能富集分析等,用于發(fā)現(xiàn)功能基因,為下一步研究提供方向。

3）原核轉(zhuǎn)錄組測序

原核轉(zhuǎn)錄組測序可以從基因表達(dá)量、基因結(jié)構(gòu)和sRNA調(diào)控功能三維度揭示不同生物性狀的分子調(diào)控機(jī)制。如通過計(jì)算各組間的差異基因并對差異基因進(jìn)行富集分析，獲得對生物性狀影響較大的通路信息；通過預(yù)測基因的反義轉(zhuǎn)錄本，豐富基因組注釋內(nèi)容；研究sRNA對mRNA的相互作用，從分子調(diào)控角度解釋生物性狀之間的差異。

4）全轉(zhuǎn)錄組測序

全轉(zhuǎn)錄組即特定細(xì)胞或組織在某一功能狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物 (mRNA、 LncRNA、 CircRNA 以及 microRNA) 的合集。全轉(zhuǎn)錄組測序可對同一個(gè)樣品同時(shí)進(jìn)行 mRNA、 LncRNA、 CircRNA 和 microRNA 的單獨(dú)分析，還可進(jìn)行多種 RNA聯(lián)合分析以及內(nèi)源競爭性 RNA 整合分析，分子標(biāo)記篩選等，探究其潛在的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)機(jī)制，揭示轉(zhuǎn)錄調(diào)控問題。主要應(yīng)用于免疫機(jī)制、疾病領(lǐng)域、發(fā)育進(jìn)化、致病機(jī)理和藥物靶標(biāo)等方面的研究。

5）三代全長轉(zhuǎn)錄組測序

基于三代測序平臺的全長轉(zhuǎn)錄組測序，可直接獲取mRNA全長序列，更為準(zhǔn)確地解讀mRNA結(jié)構(gòu)信息，重點(diǎn)關(guān)注基因的可變剪切、融合基因等。應(yīng)用領(lǐng)域：獲得基因組未知物種的基因集，用于基因功能研究；基因結(jié)構(gòu)差異分析；發(fā)現(xiàn)新轉(zhuǎn)錄本；分子機(jī)制研究；基因表達(dá)調(diào)控研究等。

樣本量推薦：

組織：200 mg

細(xì)胞：10E6

細(xì)菌：濕重0.2g

麥特繪譜生物科技（上海）有限公司（Metabo-Profile）依托香港浸會大學(xué)賈偉教授課題組匯聚了從事代謝組學(xué)和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究近二十年經(jīng)驗(yàn)的海內(nèi)外科研專家團(tuán)隊(duì)，專注于精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)和健康領(lǐng)域的高端代謝組學(xué)技術(shù)服務(wù)及科研、臨床檢測試劑盒產(chǎn)品研發(fā)。業(yè)務(wù)覆蓋臨床、藥物、動物和微生物、細(xì)胞、食品及環(huán)境等領(lǐng)域，是一家集科技服務(wù)、健康檢測及產(chǎn)品研發(fā)為一體的高新技術(shù)企業(yè)，已成為代謝組學(xué)研究者的優(yōu)選合作伙伴。

公司擁有自建的1500+功能性小分子代謝物數(shù)據(jù)庫JiaLib™、國際前沿的代謝組學(xué)分析技術(shù)平臺和全自動化數(shù)據(jù)處理軟件、代謝組學(xué)數(shù)據(jù)在線分析平臺以及自主知識產(chǎn)權(quán)的體外診斷試劑盒、智能輔助軟件及功能食品等，目前已取得 55 項(xiàng)自主研發(fā)專利及軟件著作權(quán)，獲批臨床注冊證產(chǎn)品 21 個(gè)。成立至今，麥特繪譜已為數(shù)百家三甲醫(yī)院、科研院所和企業(yè)提供高端、定制化的代謝組學(xué)一站式整體解決方案，協(xié)助客戶與合作伙伴發(fā)表SCI文章百余篇，累積影響因子600+，包括Cell Metabolism、Immunity、Gut、Hepatology、Microbiome、Nature Communications等頂級期刊。

麥特繪譜一直致力于代謝組學(xué)前沿技術(shù)方法及臨床應(yīng)用產(chǎn)品轉(zhuǎn)化，將傳統(tǒng)非靶向代謝組技術(shù)全面升級至可標(biāo)準(zhǔn)化的絕對定量方法，成功開發(fā)出業(yè)界具有影響力的代謝組學(xué)產(chǎn)品——Q300 全定量代謝芯片試劑盒，已成為全球代謝組學(xué)分析的優(yōu)選工具。目前Q300試劑盒已被應(yīng)用于檢測多個(gè)疾病大隊(duì)列人群數(shù)據(jù)，針對中國人群構(gòu)建起健康-疾病代謝數(shù)據(jù)庫，開展基于代謝組學(xué)的精準(zhǔn)醫(yī)療和大健康產(chǎn)業(yè)相關(guān)產(chǎn)品服務(wù)，逐步實(shí)現(xiàn)臨床轉(zhuǎn)化，為推動個(gè)體化精準(zhǔn)醫(yī)療服務(wù)提供標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)支持。


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