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空間代謝組學-歐易生物

空間代謝組學-歐易生物


空間代謝組學-歐易生物
空間代謝組在解吸電噴霧電離質譜成像(DESI-MSI)技術上進一步升級,形成了空氣動力輔助離子化解吸電噴霧電離質譜成像(AFAI-MSI)技術。
服務類別:測序/合成總訪問:1791
最后更新:2023-10-19半年訪問:66
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空間代謝組學

空間代謝組在解吸電噴霧電離質譜成像(DESI-MSI)技術上進一步升級,形成了空氣動力輔助離子化解吸電噴霧電離質譜成像(AFAI-MSI)技術。利用空氣流與傳輸管對帶電液滴進行遠距離傳輸,傳輸管中的帶電液滴在高速氣流和電壓的作用下進一步脫溶劑、富集、離子化,繼而提高檢測靈敏度,同時擴展了待測樣品的空間和操作靈活性,不僅適用于單一組織樣本,也適合于大體積樣品的遠距離離子采集和成像分析。

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圖 | AFADESI-MSI空間代謝組技術原理圖

 

技術流程

1)在電噴霧毛細管噴嘴上施加一定高電壓,噴霧溶劑從霧化器的內套管中流出,由外套管中噴出的高壓氮氣迅速將噴霧溶劑霧化形成帶電噴霧液滴;

2)噴出的高速帶電液滴轟擊待測樣品表面,在溶劑萃取作用下樣品同時被解吸與電離;

3)含有被測樣品的帶電液滴迅速發生去溶劑化作用,從質譜分析器的采集錐孔進入分析器并被檢測;

4)樣品固定在承載平臺,連續或脈沖移動承載平臺對樣品進行二維掃描;

5)同時質譜儀記錄質譜信號強度獲得樣品表面的分子及其含量;

6)這些信息通過質譜圖像分析軟件轉換后,即可獲得選擇離子或離子群的二維空間強度分布圖。

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技術特點

 

1)高靈敏度:靈敏度可達pg級別

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含量為pg級的硫苷脂類代謝物在大鼠腦的成像圖

2)寬動態范圍:數量級103

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甘油磷脂酰膽堿在大鼠腎組織不同區域呈3個數量級梯度差異

3)高覆蓋度:涵蓋多種類型小分子代謝物

膽堿類、多胺類、氨基酸類、肉堿類、核苷類、核苷酸類、有機酸類、碳水化合物類、膽固醇類、膽酸類、脂質類等多種類代謝物。

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4) 高特異性

高分辨分析器+強分辨力軟件

實現m/z 相近代謝物的準確識別

Δm/z =0.001

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大鼠腎臟中m/z相近代謝物的空間成像

5)高異質性

實現組織結構和功能

代謝物的識別與特征分布

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 人食管癌組織中代謝物的高異質性空間分布

 

我們的優勢

1、項目經驗

小鼠/大鼠:腦、腎、心、肝、脾、脊髓、垂體、胰腺、皮膚、整只小鼠/大鼠

腫瘤組織:食管癌、甲狀腺癌、肺癌、乳腺癌、胃癌、腦膠質瘤、鼻咽癌、皮膚癌、肝癌

植物組織:根、種子
 

2、硬件支持

自有AFAI-MSI

Thermo QE 高分辨質譜

空間分辨率(100um*100um、20um*20um)+高質量分辨率:儀器持續升級

 

3、發明專利

3項授權發明專利、1項軟件著作權(如下)

  • 敞開式噴霧場解吸離子化方法及離子化裝置,發明專利,授權號:ZL 2007 1 0303649.0

  • 質譜成像平臺裝置及其控制方法,發明專利,授權號 :ZL 2012 1 0055424.9

  • 一種離子源溫控加熱裝置,發明專利,授權號:ZL 2012 1 0348043.X

  • 一種用于生物組織質譜成像的離子傳輸裝置,實用新型專利,授權號 :ZL 201520580709.3

 

CISILE 2019自主創新金獎,2019 CAIA特等獎;

 

4、數據庫支持

LM空間代謝組學自建數據庫:SmetDB、SmetPB

SmetDB針對人和動物,目前含4000+物質,涵蓋氨基酸、脂質、核苷酸、碳水化合物、維生素和輔助因子、激素等物質;

SmetPB目前針對植物,含有6000+物質,涵蓋生物堿類、酚酸類、黃酮類、香豆素類、苯丙素類、木脂素、萜類等10大類代謝物;

 

5、軟件支持

基于大數據與人工智能的MassImager質譜成像處理軟件

 

6、服務支持

學術支持:賀玖明教授,國內早期開發空間代謝組學方法的科學家之一

PNAS、Theranostics、Advanced Science、AC等雜志發表文章10余篇(見參考文獻)

技術流程

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應用領域

醫學領域:

1)疾病分子機制,如阿爾茨海默癥、抑郁、腦缺血、糖尿病、心血管疾病等;

2)生殖發育學,如胚胎、器官發育過程中代謝調控和代謝表型等;

3)腫瘤代謝與腫瘤免疫,如腫瘤代謝微環境與腫瘤免疫逃逸等;

4)腫瘤分子病理診斷、分子分期/分型、生物標志物篩選等;

5)腫瘤耐藥與用藥研究等;

6)環境毒理學,如環境污染物的體內毒性效應和分子機制等;

7)新藥藥理和毒理,如藥物的空間分布和體內效應和分子機制等;

 

農林牧漁領域:

1)發育學,如種子、胚胎、器官發育過程中的空間代謝調控等;

2)分子機制,如鹽脅迫、病毒/真菌侵染、光合作用等機制研究;

3)基因調控機制,如轉基因、基因沉默、基因敲除后代謝物變化的機制研究,了解基因與代謝物之間的關系等

4)植物與環境互作研究,如昆蟲選擇性侵害植物部位、土壤與根部互作研究等;

5)植物藥用成分定位。

樣本準備指南

1、樣本類型

未經過福爾馬林浸泡、HE染色,熒光標記等處理的新鮮組織樣本。

5mm*2mm~2cm*4cm,大至整只大鼠/小鼠(15cm*10cm)。常規樣本大小為1cm3左右。

2、送樣準備

1)實驗前準備

預冷生理鹽水

50mL離心管中

封口膜或保鮮膜、錫箔紙、干冰、液氮、濾紙片、鑷子、記號筆等;

2)樣本處理流程

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3)送樣流程

干冰寄送時,將樣本盒埋沒于干冰中,保證其上下都有干冰覆蓋; 

干冰的量根據每天4公斤來計算,使用厚實(2cm以上厚度)的泡沫箱寄送。

4)送樣注意事項

在允許的條件下,建議多準備一份樣品作為備用;

樣本質量是影響實驗結果的最關鍵因素,因此在采集、制備、貯存、運輸過程中應盡可能地做到迅速,大幅縮短樣本從采集到實驗的時間。

儀器設備

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