空間代謝組在解吸電噴霧電離質譜成像(DESI-MSI)技術上進一步升級,形成了空氣動力輔助離子化解吸電噴霧電離質譜成像(AFAI-MSI)技術。
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空間代謝組學
空間代謝組在解吸電噴霧電離質譜成像(DESI-MSI)技術上進一步升級,形成了空氣動力輔助離子化解吸電噴霧電離質譜成像(AFAI-MSI)技術。利用空氣流與傳輸管對帶電液滴進行遠距離傳輸,傳輸管中的帶電液滴在高速氣流和電壓的作用下進一步脫溶劑、富集、離子化,繼而提高檢測靈敏度,同時擴展了待測樣品的空間和操作靈活性,不僅適用于單一組織樣本,也適合于大體積樣品的遠距離離子采集和成像分析。
圖 | AFADESI-MSI空間代謝組技術原理圖
技術流程
1)在電噴霧毛細管噴嘴上施加一定高電壓,噴霧溶劑從霧化器的內套管中流出,由外套管中噴出的高壓氮氣迅速將噴霧溶劑霧化形成帶電噴霧液滴;
2)噴出的高速帶電液滴轟擊待測樣品表面,在溶劑萃取作用下樣品同時被解吸與電離;
3)含有被測樣品的帶電液滴迅速發生去溶劑化作用,從質譜分析器的采集錐孔進入分析器并被檢測;
4)樣品固定在承載平臺,連續或脈沖移動承載平臺對樣品進行二維掃描;
5)同時質譜儀記錄質譜信號強度獲得樣品表面的分子及其含量;
6)這些信息通過質譜圖像分析軟件轉換后,即可獲得選擇離子或離子群的二維空間強度分布圖。
技術特點
1)高靈敏度:靈敏度可達pg級別
含量為pg級的硫苷脂類代謝物在大鼠腦的成像圖
2)寬動態范圍:數量級103
甘油磷脂酰膽堿在大鼠腎組織不同區域呈3個數量級梯度差異
3)高覆蓋度:涵蓋多種類型小分子代謝物
膽堿類、多胺類、氨基酸類、肉堿類、核苷類、核苷酸類、有機酸類、碳水化合物類、膽固醇類、膽酸類、脂質類等多種類代謝物。
4) 高特異性
高分辨分析器+強分辨力軟件
實現m/z 相近代謝物的準確識別
Δm/z =0.001
大鼠腎臟中m/z相近代謝物的空間成像
5)高異質性
實現組織結構和功能
代謝物的識別與特征分布
人食管癌組織中代謝物的高異質性空間分布
我們的優勢
1、項目經驗
小鼠/大鼠:腦、腎、心、肝、脾、脊髓、垂體、胰腺、皮膚、整只小鼠/大鼠
腫瘤組織:食管癌、甲狀腺癌、肺癌、乳腺癌、胃癌、腦膠質瘤、鼻咽癌、皮膚癌、肝癌
植物組織:根、種子
2、硬件支持
自有AFAI-MSI
Thermo QE 高分辨質譜
空間分辨率(100um*100um、20um*20um)+高質量分辨率:儀器持續升級
3、發明專利
3項授權發明專利、1項軟件著作權(如下)
敞開式噴霧場解吸離子化方法及離子化裝置,發明專利,授權號:ZL 2007 1 0303649.0
質譜成像平臺裝置及其控制方法,發明專利,授權號 :ZL 2012 1 0055424.9
一種離子源溫控加熱裝置,發明專利,授權號:ZL 2012 1 0348043.X
一種用于生物組織質譜成像的離子傳輸裝置,實用新型專利,授權號 :ZL 201520580709.3
CISILE 2019自主創新金獎,2019 CAIA特等獎;
4、數據庫支持
LM空間代謝組學自建數據庫:SmetDB、SmetPB
SmetDB針對人和動物,目前含4000+物質,涵蓋氨基酸、脂質、核苷酸、碳水化合物、維生素和輔助因子、激素等物質;
SmetPB目前針對植物,含有6000+物質,涵蓋生物堿類、酚酸類、黃酮類、香豆素類、苯丙素類、木脂素、萜類等10大類代謝物;
5、軟件支持
基于大數據與人工智能的MassImager質譜成像處理軟件
6、服務支持
學術支持:賀玖明教授,國內早期開發空間代謝組學方法的科學家之一
PNAS、Theranostics、Advanced Science、AC等雜志發表文章10余篇(見參考文獻)
技術流程
應用領域
醫學領域:
1)疾病分子機制,如阿爾茨海默癥、抑郁、腦缺血、糖尿病、心血管疾病等;
2)生殖發育學,如胚胎、器官發育過程中代謝調控和代謝表型等;
3)腫瘤代謝與腫瘤免疫,如腫瘤代謝微環境與腫瘤免疫逃逸等;
4)腫瘤分子病理診斷、分子分期/分型、生物標志物篩選等;
5)腫瘤耐藥與用藥研究等;
6)環境毒理學,如環境污染物的體內毒性效應和分子機制等;
7)新藥藥理和毒理,如藥物的空間分布和體內效應和分子機制等;
農林牧漁領域:
1)發育學,如種子、胚胎、器官發育過程中的空間代謝調控等;
2)分子機制,如鹽脅迫、病毒/真菌侵染、光合作用等機制研究;
3)基因調控機制,如轉基因、基因沉默、基因敲除后代謝物變化的機制研究,了解基因與代謝物之間的關系等
4)植物與環境互作研究,如昆蟲選擇性侵害植物部位、土壤與根部互作研究等;
5)植物藥用成分定位。
樣本準備指南
1、樣本類型
未經過福爾馬林浸泡、HE染色,熒光標記等處理的新鮮組織樣本。
5mm*2mm~2cm*4cm,大至整只大鼠/小鼠(15cm*10cm)。常規樣本大小為1cm3左右。
2、送樣準備
1)實驗前準備
預冷生理鹽水
50mL離心管中
封口膜或保鮮膜、錫箔紙、干冰、液氮、濾紙片、鑷子、記號筆等;
2)樣本處理流程
3)送樣流程
干冰寄送時,將樣本盒埋沒于干冰中,保證其上下都有干冰覆蓋;
干冰的量根據每天4公斤來計算,使用厚實(2cm以上厚度)的泡沫箱寄送。
4)送樣注意事項
在允許的條件下,建議多準備一份樣品作為備用;
樣本質量是影響實驗結果的最關鍵因素,因此在采集、制備、貯存、運輸過程中應盡可能地做到迅速,大幅縮短樣本從采集到實驗的時間。
儀器設備