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生物發(fā)光技術(shù)在生命科學(xué)中的應(yīng)用

瀏覽次數(shù):3741 發(fā)布日期:2014-10-27  來源:生物物理學(xué)報(bào)

隨著發(fā)光(luminescence)技術(shù)在多種生物實(shí)驗(yàn)中的廣泛應(yīng)用,生物發(fā)光(bioluminescence)技術(shù)越來越成為首選的生物檢測(cè)手段。在這篇文章中,我們將詳細(xì)討論生物發(fā)光技術(shù)在生物檢測(cè)中的應(yīng)用,以及它與其它發(fā)光檢測(cè)手段相比所顯示出的優(yōu)點(diǎn)。

1 生物發(fā)光的特點(diǎn)

根據(jù)產(chǎn)生光子的能量來源不同,發(fā)光可分為以下四大類,一是熒光(fluorescence):依靠光子發(fā)光;二是化學(xué)發(fā)光(chemiluminescence):依靠化學(xué)能量發(fā)光;三是輻射發(fā)光:依靠放射性能量發(fā)光;四是電能發(fā)光:依靠電能量發(fā)光。其中,生物發(fā)光(bioluminescence)是依靠天然的酶促化學(xué)反應(yīng)產(chǎn)生的能量而發(fā)光,屬于化學(xué)發(fā)光,它天然地存在于許多生物體內(nèi),例如螢火蟲、深海里的水母和一些細(xì)菌。目前,在生命科學(xué)研究中,應(yīng)用最為廣泛的是熒光和化學(xué)發(fā)光。而生物發(fā)光作為化學(xué)發(fā)光的重要類別,也日益受到廣泛關(guān)注和應(yīng)用。物質(zhì)發(fā)光的機(jī)理是:分子首先受到激發(fā),吸收能量,從穩(wěn)定的基態(tài)躍遷到不穩(wěn)定的激發(fā)態(tài),而當(dāng)它從激發(fā)態(tài)返回到基態(tài)時(shí),能量就以光子的形式釋放出來(圖1),檢測(cè)發(fā)出的光子就能確定發(fā)光分子的存在。發(fā)光技術(shù)能否在生物檢測(cè)中得到應(yīng)用及其應(yīng)用的范圍,在很大程度上取決于激發(fā)分子的能量來源。因?yàn)榧ぐl(fā)能量的來源不同,其產(chǎn)生的相對(duì)信號(hào)強(qiáng)度(信號(hào)對(duì)本底的相對(duì)值)則不同,對(duì)檢測(cè)器的靈敏度要求也不同。以生物發(fā)光和熒光為例:對(duì)于熒光來講,一方面,由于熒光的光子能量吸收效率高,分子可以釋放大量的光能,從而產(chǎn)生高強(qiáng)度的光信號(hào),利于檢測(cè);另一方面,這種高流量的激發(fā)光子有時(shí)會(huì)嚴(yán)重干擾光感檢測(cè)器發(fā)射光子的分析能力,同時(shí)也可能激發(fā)生物樣品本身含有的熒光團(tuán),而產(chǎn)生其它非特異的發(fā)射光,進(jìn)而導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)本底過高。也正是由于熒光的這種特性,即報(bào)告基團(tuán)中高強(qiáng)度的信號(hào)與高強(qiáng)度的實(shí)驗(yàn)本底共存,使得其檢測(cè)相對(duì)信號(hào)強(qiáng)度的能力大大降低。對(duì)于生物發(fā)光來講,它與熒光形成鮮明對(duì)照,因?yàn)樯锇l(fā)光依靠天然的酶促化學(xué)反應(yīng)發(fā)光,不需要引進(jìn)外源的光能,所以應(yīng)用生物發(fā)光作為檢測(cè)手段的報(bào)告基團(tuán)的實(shí)驗(yàn)本底很底。雖然生物發(fā)光的信號(hào)強(qiáng)度沒有熒光那么高,但由于其獨(dú)特的發(fā)光原理,生物發(fā)光可以比熒光敏感一百甚至一千倍以上[1,2]。這是生物發(fā)光越來越成為很多生物研究領(lǐng)域首選的生物檢測(cè)手段的原因之一。

在實(shí)際應(yīng)用時(shí),需要反復(fù)權(quán)衡信號(hào)強(qiáng)度的要求和實(shí)驗(yàn)本底的影響,以選擇最佳的檢測(cè)技術(shù)。在光子檢測(cè)能力比較低的情況下,實(shí)驗(yàn)本底很大程度上取決于儀器檢測(cè)的對(duì)象,例如顯微鏡和流式細(xì)胞儀,由于需要檢測(cè)單個(gè)細(xì)胞光學(xué)信號(hào)的變化,對(duì)發(fā)射光信號(hào)的強(qiáng)度要求非常高,因此,熒光通常會(huì)成為這一類應(yīng)用領(lǐng)域的首選。然而,當(dāng)需要檢測(cè)大量的生物樣品的時(shí)候,對(duì)光子檢測(cè)能力的要求就會(huì)相應(yīng)降低,對(duì)降低實(shí)驗(yàn)本底的要求相應(yīng)會(huì)增加,比如在檢測(cè)單個(gè)試管樣品、多孔培養(yǎng)板樣品,或者對(duì)器官(如老鼠器官)進(jìn)行圖像分析的時(shí)候,生物發(fā)光因其低本底和高靈敏度而倍受歡迎。而且由于生物發(fā)光檢測(cè)器不需要使用光學(xué)濾片,從而為縮短樣品和檢測(cè)器之間的距離提供了可能,由此也更加提高了檢測(cè)的效率。生物發(fā)光的靈敏度可以達(dá)到10-20 mol,相當(dāng)于6,000多個(gè)螢光素酶分子。對(duì)于一個(gè)有幾百個(gè)細(xì)胞的生物樣品來說,一個(gè)細(xì)胞里只要有幾個(gè)分子的螢光素酶就可以被檢測(cè)到。而且生物發(fā)光的高靈敏度使得它可以檢測(cè)的濃度范圍非常寬,大多數(shù)可以跨越6~8個(gè)數(shù)量級(jí),而且現(xiàn)代生物發(fā)光檢測(cè)儀技術(shù)的更新也使得如此大跨度的檢測(cè)成為可能。另外,由于生物發(fā)光來源于天然生物體內(nèi)的酶促化學(xué)發(fā)光反應(yīng),當(dāng)將其引進(jìn)生物樣品內(nèi)的時(shí)候,對(duì)正常的生物活動(dòng)不會(huì)添加太多負(fù)面影響。而且,因?yàn)槲灩馑孛傅牡孜镌诜磻?yīng)時(shí)是被包裹在螢光素酶分子的內(nèi)部,從而可以在最大限度上保護(hù)正常的酶促發(fā)光反應(yīng)不受外界的干擾。

2 生物發(fā)光作為報(bào)告基因的應(yīng)用及其優(yōu)點(diǎn)

生物發(fā)光在生命科學(xué)研究中最廣泛的應(yīng)用是作為監(jiān)測(cè)基因轉(zhuǎn)錄活動(dòng)的報(bào)告基因。其中,螢火蟲體內(nèi)天然存在的螢光素酶通常是研究人員的首選。螢火蟲的螢光素酶是一個(gè)61kDa的單體蛋白,它主要催化作用于名為螢光素(luciferin)的螢光素酶底物,在有ATP和氧氣存在的條件下產(chǎn)生黃綠色的光(發(fā)射光波長(zhǎng)是560 nm)。

當(dāng)使用報(bào)告基因來監(jiān)測(cè)基因轉(zhuǎn)錄活性的時(shí)候,研究人員最大的顧慮是引進(jìn)外源的報(bào)告基因可能會(huì)影響正常的生物活性,尤其是當(dāng)報(bào)告基因通常需要和生物體內(nèi)自身細(xì)胞的分子活動(dòng)相聯(lián)系時(shí),高濃度的外源基因會(huì)過分加重生物內(nèi)部細(xì)胞活動(dòng)的負(fù)擔(dān),從而影響正常的生理活動(dòng),甚至造成不正常的生理現(xiàn)象。因此,盡量降低報(bào)告基因的濃度就成為研究成功的關(guān)鍵。以綠色熒光蛋白為例,它是一類天然存在的發(fā)光蛋白,由于它能產(chǎn)生高強(qiáng)度的發(fā)射熒光,所以可以獲得非常清晰、生動(dòng)的顯微圖像,在單細(xì)胞生物圖像分析中已經(jīng)得到廣泛應(yīng)用。但因?yàn)榍逦鷪D像的產(chǎn)生通常需要綠色熒光蛋白高濃度表達(dá),從而加重了生物內(nèi)部細(xì)胞活動(dòng)的負(fù)擔(dān),使得綠色熒光蛋白不適合作為監(jiān)測(cè)基因轉(zhuǎn)錄活動(dòng)的報(bào)告基因。所以在選擇合適的報(bào)告基因時(shí),特別是和綠色熒光蛋白相比較之后,生物發(fā)光由于其低表達(dá)和高靈敏度使其在眾多的選擇中脫穎而出。

監(jiān)測(cè)基因轉(zhuǎn)錄活性要求報(bào)告基因能夠快速監(jiān)測(cè)目標(biāo)基因細(xì)微的動(dòng)態(tài)變化。細(xì)胞內(nèi)報(bào)告基因的濃度取決于兩大動(dòng)態(tài)過程:即蛋白合成過程(受基因轉(zhuǎn)錄活性的調(diào)控)和蛋白降解過程。如果蛋白降解過程很慢,則會(huì)使蛋白高度穩(wěn)定,從而會(huì)造成蛋白的本底表達(dá)水平過高,那么基因轉(zhuǎn)錄活性改變所產(chǎn)生的新蛋白的合成就不容易被檢測(cè)到。這樣一來,報(bào)告基因的表達(dá)就不能準(zhǔn)確地反應(yīng)基因轉(zhuǎn)錄活性的變化。實(shí)驗(yàn)證明,在螢光素酶的序列上添加蛋白降解序列,如小鼠鳥氨酸脫羧酶(mouse ornithine decarboxylase, ODC)中富含脯氨酸- 谷氨酸- 絲氨酸- 蘇氨酸(proline-glutamate-serinethreoninerich,PEST)的序列,可以顯著地提高檢測(cè)技術(shù)的應(yīng)答性,并且不會(huì)對(duì)檢測(cè)手段的靈敏度造成太大影響[3]。與之相反,由于綠色熒光蛋白的高表達(dá)和高穩(wěn)定性,使得添加蛋白降解信號(hào)反而在很大程度上限制了檢測(cè)的靈敏度。

為了進(jìn)一步提高檢測(cè)基因的效率,我們對(duì)螢光素酶基因序列的密碼子進(jìn)行了優(yōu)化,使得它在多種哺乳細(xì)胞中的表達(dá)水平提高了5~10倍;同時(shí),為了減少對(duì)基因的非特異性調(diào)控,我們也對(duì)螢光素酶的載體進(jìn)行了優(yōu)化,去除了載體上哺乳動(dòng)物轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合序列的保守序列,從而大大降低了實(shí)驗(yàn)的本底,顯著提高了實(shí)驗(yàn)的相對(duì)信號(hào)強(qiáng)度。優(yōu)化后的螢光素酶報(bào)告基因可以成功地應(yīng)用在各項(xiàng)生物研究領(lǐng)域中,例如對(duì)腫瘤壞死因子信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的研究。腫瘤壞死因子是由單核- 巨噬細(xì)胞產(chǎn)生的能致腫瘤細(xì)胞壞死的活性因子,能加強(qiáng)中性粒細(xì)胞的吞噬和消化功能,促進(jìn)其粘附于血管內(nèi)皮和遷移出血管之外,并能激活轉(zhuǎn)錄因子NF- B調(diào)控的包括IL-1、GM-CSF在內(nèi)的多種基因的表達(dá)。在外源表達(dá)NF- B螢光素酶報(bào)告基因的HEK293 細(xì)胞中,腫瘤壞死因子的刺激可以有效地使螢光素酶的表達(dá)提高1000 倍以上(圖2A)。同樣的檢測(cè)方法也可以成功地檢測(cè)腫瘤壞死因子阻斷劑對(duì)腫瘤壞死因子生物活性的阻斷效率(IC50=0.77 nmol,圖2B)。

3 生物發(fā)光的其它應(yīng)用

生物發(fā)光的強(qiáng)度取決于酶促化學(xué)反應(yīng)中的各個(gè)反應(yīng)成分的濃度,包括熒光素酶濃度、ATP濃度和螢光素酶底物即螢光素的濃度。通常,在生物發(fā)光的檢測(cè)體系中,如果保持其它成分的濃度過量且恒定,就可以檢測(cè)與生物活性相關(guān)的某個(gè)特定成分的濃度變化。我們上面談到的用螢光素酶作為報(bào)告基因來監(jiān)測(cè)基因轉(zhuǎn)錄活性的實(shí)驗(yàn),就是把螢光素酶濃度和基因轉(zhuǎn)錄活性直接關(guān)聯(lián)起來,螢光素酶濃度是我們的最終監(jiān)測(cè)目標(biāo)。此外,如果我們固定螢光素酶的濃度并使其過量,生物發(fā)光還可以用來監(jiān)測(cè)與ATP或螢光素濃度相關(guān)的生物學(xué)活性(圖3)。

通過檢測(cè)螢光素的濃度來監(jiān)測(cè)某一生物學(xué)活性的實(shí)驗(yàn)原理是:在螢光素上添加一個(gè)化學(xué)基團(tuán)進(jìn)行修飾,建立一個(gè)螢光素酶無法識(shí)別的"修飾"底物,而只有通過特定的生物反應(yīng)切除這個(gè)化學(xué)基團(tuán),螢光素才能恢復(fù)活性,酶促反應(yīng)才能發(fā)生,這樣我們就可以把生物發(fā)光的強(qiáng)度和這個(gè)特定的生物反應(yīng)聯(lián)系起來[1]。如圖4所示,Asp-Glu-Val-Asp-6'-aminoluciferin是一個(gè)沒有活性的螢光素衍生物,只有當(dāng)半胱氨酸-天冬氨酸蛋白酶(caspase-3)存在并切除這個(gè)四肽的序列,釋放出游離的螢光素時(shí),螢光素酶酶促反應(yīng)才能發(fā)生。因?yàn)榘腚装彼?天冬氨酸蛋白酶的活性是檢測(cè)細(xì)胞凋亡的一個(gè)重要指標(biāo),這樣的設(shè)計(jì)使生物發(fā)光成為一個(gè)有效的檢測(cè)細(xì)胞凋亡的手段。當(dāng)然這一設(shè)計(jì)也可以用于運(yùn)用熒光的細(xì)胞凋亡檢測(cè)上,即把同樣四肽的序列加到熒光染料Rhodamine110上。但由于生物發(fā)光獨(dú)特的低表達(dá)和高靈敏度,在相同的實(shí)驗(yàn)條件下,運(yùn)用生物發(fā)光研究細(xì)胞凋亡,其敏感性比運(yùn)用熒光技術(shù)高將近一百倍(圖4)。類似的設(shè)計(jì)也可以用來利用生物發(fā)光檢測(cè)其它蛋白酶的活性,比如caspase-8、caspase-9、二肽基肽酶Ⅵ(DPPIV)、caspase-3、鈣蛋白酶(calpain)、蛋白酶體(proteosome)等,并且還可以檢測(cè)其它如CYP450活性、單氨氧化酶等的酶促反應(yīng)[2]。

生物發(fā)光最早用于檢測(cè)ATP的濃度,并且迄今為止仍然是快速檢測(cè)細(xì)胞活力最廣泛使用的方法之一[4]。與基于熒光的細(xì)胞活力檢測(cè)方法(如使用tetrazolium)相比,用生物發(fā)光來檢測(cè)哺乳細(xì)胞的生物活性,其敏感度要高達(dá)一百倍以上,而且只需要5 min。用生物發(fā)光來檢測(cè)細(xì)菌的生物活性,靈敏度非常高,細(xì)菌個(gè)數(shù)小于10時(shí),都可以被檢測(cè)到。用生物發(fā)光檢測(cè)ATP的方法還可用于檢測(cè)消耗ATP的生物酶的濃度。以激酶為例,由于它可以作用于不同的磷酸鹽受體,包括蛋白、脂類和多糖底物,這種方法可以作為一個(gè)通用的檢測(cè)激酶活性的手段。最近,我們利用cAMP對(duì)蛋白激酶A的調(diào)控和蛋白激酶A的激酶反應(yīng)對(duì)ATP的消耗建立了一個(gè)檢測(cè)cAMP濃度變化的生物發(fā)光檢測(cè)方法[5]。具體來說,細(xì)胞內(nèi)cAMP的濃度可調(diào)節(jié)蛋白激酶A 的活性,而蛋白激酶A被激活后催化相應(yīng)的磷酸化反應(yīng)則需要消耗ATP,這樣一來細(xì)胞內(nèi)ATP濃度就會(huì)降低,因此,我們檢測(cè)到的ATP的濃度就與蛋白激酶A的活性成反比,也與cAMP的濃度成反比。由于我們能夠?qū)⑸锇l(fā)光和ATP濃度直接關(guān)聯(lián)起來,所以我們建立了一個(gè)細(xì)胞內(nèi)檢測(cè)G蛋白-偶聯(lián)受體活性或磷酸去脂酶活性的快速敏感的檢測(cè)方法。

4 結(jié)語

生物發(fā)光在復(fù)雜的生物有機(jī)體研究中具有巨大的潛力和價(jià)值。無論是它在很低的濃度下就可以發(fā)出清晰并定量的信號(hào)這一特性,還是它在哺乳細(xì)胞中低本底的優(yōu)點(diǎn),都使得生物發(fā)光技術(shù)在揭示生命奧秘的過程中擁有獨(dú)特的地位。因此,生物發(fā)光檢測(cè)技術(shù)必將在基礎(chǔ)生命科學(xué)研究和新藥開發(fā)等諸多領(lǐng)域發(fā)揮越來越強(qiáng)大的作用。(生物谷Bioon.com)

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