高通量測序服務——轉錄組測序
詳細描述:
轉錄組即某個物種或特定細胞在某一功能狀態下產生的所有RNA的總和,是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是,轉錄組的定義中包含了時間和空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環境下,其基因表達情況是不完全相同的。轉錄組測序(RNA-Seq)是指利用第二代高通量測序技術進行cDNA測序,全面快速地獲取某一物種特定器官或組織在某一狀態下的幾乎所有轉錄本。相對于傳統芯片而言,RNA-Seq無需預先設計探針,即可對任意物種的任意細胞類型的轉錄組進行檢測,能夠提供更精確的數字化信號,更高的檢測通量以及更廣泛的檢測范圍,是目前深入研究轉錄組復雜性的強大工具。
美吉優勢
1. 擁有標準化操作實驗室和高通量測序技術平臺,可以根據合作伙伴要求靈活安排實驗,實驗周期短,質量可靠。
2. 擁有Roche 454和Illumina Solexa兩種高通量測序平臺,合作伙伴可根據具體需求進行選擇,以獲取最佳的實驗結果。
3. 技術人員經驗豐富,可以根據合作伙伴要求在第一時間提供實驗方案、解決實驗問題、分析實驗結果。
4. 擁有專業的生物信息團隊和大型計算機,可以為合作伙伴提供個性化的生物信息分析服務。
生物信息分析
1. 有參考基因組的轉錄組分析(Transcriptome analysis with reference genome)
1)測序原始數據處理(質量剪切、污染序列去除等)
2)Contig和Unigene統計分析
3)Unigene功能注釋(NR、GO 和KEGG等)
4)SNPs及SSR分析等
5)基因表達差異分析(不少于兩個樣品)
2. 無參考基因組轉錄組分析 (De novo Transcriptome Analysis)
1)測序原始數據處理(質量剪切、污染序列去除等)
2)短序列mapping至參考基因組序列
3)基因功能注釋
4)基因結構分析
5)可變剪切分析
6)基因表達差異分析(不少于兩個樣品)
7)預測新的基因
成功案例
美吉生物已成功完成包括線蟲、牡蠣、對蝦、蜜蜂、鯽魚、鯉魚、雞、豬、油菜花、菊花、桃樹等多個物種的轉錄組測序及分析。
最新發表文章
Nie QH, Fang MX, Jia XZ, et al. Analysis of muscle and ovary transcriptome of Sus scrofa: assembly, annotation and marker discovery. DNA Res, 2011, published on line.
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上海美吉生物醫藥科技有限公司專注于新一代DNA高通量測序技術的應用和推廣、生物信息分析、臨床診斷試劑盒研發和轉化醫學研究,是上海張江高科技園區、張江藥谷重點支持企業,華東師范大學戰略合作單位。目前,美吉生物在上海、北京、廣州三個一線城市建立了實驗基地,銷售網絡遍布全國各地。
美吉生物擁有世界一流的測序平臺,在ABI3730xl常規測序平臺的基礎上,先后引進了羅氏454高通量測序平臺和Illumina高通量測序平臺,專業提供動植物基因組測序、微生物基因組測序、宏基因組測序、轉錄組測序、小RNA測序、基因表達譜分析等技術服務。
美吉生物擁有一支實力雄厚的技術團隊,有從事分子生物學研究十多年、經驗豐富的技術骨干,也有創新進取、拼勁十足的希望之星。技術團隊經驗豐富,曾參與水稻、番茄、家蠶等多項大型基因組學項目,可以為您提供專業、合理、高性價比的實驗方案。
生物信息學是國際前沿的新興學科,近年來發展迅猛。美吉生物擁有一支具有國際一流水平的生物信息分析團隊,不僅可以提供標準流程化的生物信息分析,還可以根據不同的課題需求,提供個性化的深度數據挖掘。
B2B(Bench to Bedside)的轉化醫學模式,大大縮短了醫學科學從基礎研究到臨床應用的時間,加速了人類進入基因組醫學時代的步伐。基于對未來醫學發展趨勢的充分理解,美吉生物和國內多家著名三甲醫院聯合建立了轉化醫學中心,開展轉化醫學研究,以迎接基因組醫學時代的到來。
美吉生物秉承“專業、卓越”的企業理念,“以客戶為本,讓客戶滿意”的服務宗旨,一如既往地致力于提供高品質、高效率的技術服務,努力將公司打造成為國內一流企業。因為敬業,所以專業;因為專業,所以選擇;選擇美吉,選擇滿意!